利用ssGSEA估计不同风险组中28个免疫细胞的浸润分数,发现25种免疫细胞的浸润水平差异具有统计学意义(图7A)。Pearson相关性结果表明预后基因和风险评分均与浸润免疫细胞显着相关(图7B)。16个GEP基因(炎症基因)和四个免疫检查点在高风险和低风险组中显着不同(图7C)。通过 SubMap分析,作者发现CTLA-4免疫位点在Roh队...
肿瘤免疫微环境及免疫浸润--TISIDB免疫研究及免疫细胞基因集数据下载发布于 2020-12-27 17:02 · 973 次播放 赞同1添加评论 分享收藏喜欢 举报 肿瘤DC-CIK细胞免疫疗法免疫免疫学胚胎干细胞药物靶点 写下你的评论... 暂无评论相关...
最新6分+非肿瘤的免疫浸润纯生信思路!3种机器学习算法齐上阵,筛选线粒体自噬相关诊断基因!还告诉你不用发愁样本收集,全靠这个数据/SCI论文/科研/研究生/生信 尔云间 852 0 热门又百搭的线粒体与细胞花式死亡,揭秘性价比最高的切入方式!/SCI论文/科研/研究生/生信分析热点思路 尔云间 817 0 8分+双疾病生信...
为了确定AS中的氧化应激和免疫相关的生物标志物。本文利用GEO数据集识别并鉴定与氧化应激相关的DEGs。其次利用生物信息学方法比较AS和对照样品免疫浸润水平的差异,构建PPI网络鉴定出关键的AS诊断标志物,并在其他数据集中进行了验证。利用相关性分析和单细胞分析,表明ALOX5和NCF2是铁死亡的差异表达基因。随后利用PCR、免疫...
在这项研究中，作者利用生物信息学方法构建了HLA模型，并探索HLA模型与免疫细胞浸润、免疫相关通路和细胞因子水平之间的关系。研究结果显示，HLA模型可以有效反映免疫状态，有希望作为早期诊断脓毒症和识别风险预后的有力工具。流程图 研究结果 一、HLA基因的鉴定及模型构建 1、从GEO和ArrayExpress数据库确定相关转录组数据...
生物信息数据分析教程视频——17-多种算法评估肿瘤免疫细胞浸润水平 数据分析数据库sqlidehttp 生物信息数据分析教程视频——13-3种R包(DESeq2、edgeR和limma)进行RNAseq的差异表达分析与比较 DoubleHelix 2022/12/16 1.3K0 生物信息数据分析教程视频——11-筛选相关性基因 ...
基于凝血signature分析肿瘤微环境! 我们做基础研究是为了什么?当然是要解决临床问题呀!那么利用生信分析解决临床问题,最能体现生信的价值! 文章题目:肝细胞癌中凝血相关基因的免疫浸润及临床意义分析 发表杂志: Briefings in bioinformatics 影响因子:IF=13.994
1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因。 2 单个疾病结合免疫浸润,铁死亡,自噬等基因集,机器学习算法等。 3 两种相关疾病联合分析,包括非肿瘤结合非肿瘤,非肿瘤结合肿瘤或者非肿瘤结合泛癌分析 4 基于分型的非肿瘤生信分析 目前非肿瘤生信发文的门槛较低,有需要的朋友欢迎交流 ...
在这项研究中,作者利用Lasso回归和随机森林模型确定了5个HLA基因(B2M、HLA-DQA1、HLA-DPA1、TAP1和TAP2)并构建预测模型。研究结果表明,该模型与氢化可的松反应、免疫抑制状态、免疫细胞浸润、免疫相关通路以及细胞因子水平密切相关,有能力成为早期诊断脓毒症并识别不良预后的强大标志物。
1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因。 2 单个疾病结合免疫浸润,铁死亡,自噬等基因集,机器学习算法等。 3 两种相关疾病联合分析,包括非肿瘤结合非肿瘤,非肿瘤结合肿瘤或者非肿瘤结合泛癌分析 4 基于分型的非肿瘤生信分析 目前非肿瘤生信发文的门槛较低,有需要的朋友欢迎联系小编咨询 研究概述: 动脉粥样硬化(AS)是一...