作者通过单细胞(scRNA)结合空间(Spatial transcriptome,ST)转录组测序技术综合地探索原发结直肠癌(CRC)及肝转移CRC(CRCLM)的细胞图谱的转录水平的差异,从27个样本(取自6名CRC患者)中得到41,892个CD45-非免疫细胞及196,473个CD45+免疫细胞。经分析作者发现呈现出高增殖能力和肿瘤激活特征的肝转移样本的CD8_CXCL13...
在全球范围内结直肠癌(CRC)是第三大最常见的恶性肿瘤,约21~26%的患者会发生同步转移疾病,其中14.5~17.5%的患者会发生肝转移。转移的CRC往往预后很差,CRCLM导致巨大的临床挑战。转移过程是个多步骤事件,而癌细胞和基质细胞之间能够通过分泌...
研究团队运用多种手段解析结直肠癌的肿瘤微环境,发现 FAP+ fibroblasts 与 SPP1+ macrophages 在结直肠癌中显著浸润并和不良预后及肿瘤免疫治疗耐受相关,同时肿瘤边界区域附近出现二者互作形成“墙壁”样细胞外基质屏障,阻滞细胞毒性 T 淋巴细胞(CTL)进入肿瘤使其无法浸润,从而提出肿瘤免疫治疗耐受的新机制。 研究应用:...
采用Visium HD空间转录组技术，结合FFPE单细胞测序、单细胞TCR测序、Visium V2空转（Cytassis Visium）以及Xenium原位检测技术，对结直肠癌肿瘤微环境中的免疫细胞群体进行了深入表征。
作者通过单细胞(scRNA)结合空间(Spatial transcriptome,ST)转录组测序技术综合地探索原发结直肠癌(CRC)及肝转移CRC(CRCLM)的细胞图谱的转录水平的差异,从27个样本(取自6名CRC患者)中得到41,892个CD45-非免疫细胞及196,473个CD45+免疫细胞。经分析作者发现呈现出高增殖能力和肿瘤激活特征的肝转移样本的CD8_CXCL13...
1、单细胞转录组学分析揭示结直肠癌中异质性肿瘤干细胞样细胞及其器官特异性转移 Single-cell transcriptomic analysis deciphers heterogenous cancer stem-like cells in colorectal cancer and their organ-specific metastasis Gut; IF:24.500; DOI: 10.1136/gutjnl-2023-330243 ...
本期《精准前沿》栏目分享上海交通大学医学院上海市免疫学研究所苏冰教授团队和叶幼琼研究员团队发表于Nature Communications(IF =17.694)上的一篇研究[1],本文利用单细胞转录组、空间转录组、免疫荧光成像等技术手段对结直肠癌的肿瘤微环境...
1、单细胞和空间转录组学绘制可切除CRLM中的免疫细胞多样性 为了获得CRLM的单细胞图谱,本研究应用scRNA-seq和ST来量化CD45+细胞的动力学(图 1A),使用结直肠癌(CRC)组织及癌旁、肝转移(LM)组织及癌旁,沿结肠的淋巴结(LN)组织和外周血单核细胞(PBMC)。根据严格的筛选标准,共招募24 名可切除的CRLM患者。最终共...
综上所述,本研究使用单细胞和空间转录组RNA测序全面绘制了结直肠癌和匹配的肝转移CRC的细胞图谱。结直肠癌原发灶和肝转移灶的不同表型和主要细胞类型,如CAF、CD8+T细胞和肿瘤相关巨噬细胞的频率高度变化,提示TME内的分子异质性,并为未来的肿瘤治疗提供了潜在的靶点。
1、CRC原发肿瘤和CRC来源的肝转移肿瘤的总体单细胞转录组图谱 为了阐明CRC原发肿瘤和CRC来源的肝转移肿瘤的细胞异质性,作者从六名CRC患者的原发结直肠癌(CC)、相邻正常结直肠粘膜(CN)、肝转移(LM)、相邻正常肝组织(LN)以及外周血(PB)中收集了CD45−非免疫细胞和CD45+免疫细胞进行单细胞转录组分析(图1A)。