(3)针对目前单细胞领域的细胞类型注释方法大多较为依赖先验知识,且泛化性较差等诸多问题,本研究借鉴了自然语言处理领域的BERT模型,提出了一种创新性的基于掩码自监督模型的细胞类型注释算法,用于对单细胞RNA测序数据进行精准的细胞类型注释。该方法...
该方法首先通过精细定位筛选GWAS和单细胞eQTL的因果变异,随后通过遗传共定位分析鉴定细胞类型特异性共定位信号,识别工具变量;最后利用双样本MR分析判断细胞类型特异性因果效应。通过将这一方法应用于不同的肥胖表型GWAS数据,结果发现BMI可能通过...
因此,开发一种高灵敏多表型tEVs的分析方法可以提高疾病诊断的准确率和实时监测疾病的进展,从而为患者制定精准治疗的方案,以达到最佳的临床效果。目前用于tEVs分析的方法大多还侧重于单个生物标志物的特异性识别,忽略了tEVs的异质性,并可能遗漏有关疾病进展的重要信息,导致其tEVs识别的准确性不足。此外tEVs的异质性...
大部分(145 个metacells)的CD8T细胞可被细分为“过渡性” CD8T细胞(GZMK +),细胞毒性CD8T细胞(GZMH +)和大量功能失调的CD8 T细胞。功能失调CD8T细胞高表达免疫检查点分子,如PD-1和LAG3。分析显示在转录组的空间里这些不同CD8细胞类群之间的边界是弥散的,表明转录组的梯度表达是导致T细胞异质性的原因之一。 CD4 ...
它是在单个细胞层面对基因组或转录组进行深度分析的技术。🌟和传统的多细胞测序相比,它能够揭示细胞异质性的秘密,尤其在复杂如肿瘤样本中显得尤为重要。今天,就让我们一起来深入了解8种常见的生信图解分析方法!👩🔬🧬 1⃣️ 降维聚类分析(t-SNE图):通过t-SNE图,我们可以直观地看到成千上万个细胞...
02DVP定义亚细胞水平的单细胞异质性 将DVP工作流程应用于未受干扰的癌细胞系,以确定DVP是否可以表征表面相似细胞之间的功能异质性。基于DL算法进行细胞核和细胞膜检测分割后,每个表型分离到80-100个单细胞和250-300个细胞核(图3a-b)。使用超低量样品处理工作流程,直接在384孔板中处理样品,它省略了任何样品转移步骤并...
一种交互式细胞异质性分析可视化平台及其实现方法专利信息由爱企查专利频道提供,一种交互式细胞异质性分析可视化平台及其实现方法说明:本发明公开了一种交互式细胞异质性分析可视化平台及方法,所述平台包括:细胞亚群分类分析模块,用于...专利查询请上爱企查
B老师:我的单细胞数据分析一共得到了15个cluster,我觉得cluster数量偏少,有个别cluster在鉴定时可以看到有两种细胞亚型,可不可以获得更多的细胞cluster?C老师:我的单细胞数据分析采用的是tSNE降维方法,能否用umap的降维方法进行分析?D老师:我的单细胞数据2个样本间异质性非常大,是否可以去除2个样本间的批次效应?您是...
大部分(145 个metacells)的CD8T细胞可被细分为“过渡性” CD8T细胞(GZMK +),细胞毒性CD8T细胞(GZMH +)和大量功能失调的CD8 T细胞。功能失调CD8T细胞高表达免疫检查点分子,如PD-1和LAG3。分析显示在转录组的空间里这些不同CD8细胞类群之间的边界是弥散的,表明转录组的梯度表达是导致T细胞异质性的原因之一。 CD4 ...
大部分(145 个metacells)的CD8T细胞可被细分为“过渡性” CD8T细胞(GZMK +),细胞毒性CD8T细胞(GZMH +)和大量功能失调的CD8 T细胞。功能失调CD8T细胞高表达免疫检查点分子,如PD-1和LAG3。分析显示在转录组的空间里这些不同CD8细胞类群之间的边界是弥散的,表明转录组的梯度表达是导致T细胞异质性的原因之一。 CD4 ...