百泰派克生物科技采用先进的数据分析平台，结合算法和生物信息学工具对单细胞蛋白质组学质谱数据进行深入挖掘。通过对单细胞蛋白质组的定性分析，科研人员能够识别出特定的蛋白质种类及其丰度变化。同时，数据还将揭示蛋白翻译后修饰（如磷酸化、糖基化等）的动态变化，进一步帮助分析细胞的功能状态和异质性。单细胞蛋白质...
因此,复杂组织的细胞异质性分析有必要补足RNA剪接谱这一关键维度的缺失。 针对这一重要需求,清华大学生命学院杨雪瑞课题组开发了生物信息工具SCASL (single-cell clustering based on alternative splicing landscapes),用于单细胞RNA剪接谱异质...
针对每一个样本的恶性细胞,计算细胞间表达的相关性,对相关性矩阵进行四分卫偏差分析(IQR),IQR值越大,细胞表达越不相似,异质性越高。文章首先根据分子亚型将样本分为LUAD和LUSC组,再根据分子亚型和是否存在突变分为有突变组LUADm、无突变组LUADn、无突变组LUSCn,通过异质性分析发现LUSCn相比于LUADm组 ITHCNA异质性...
单细胞转录组学和蛋白质组学技术使研究人员能够在单细胞水平上解析基因表达和蛋白质丰度,为揭示组织及肿瘤的细胞异质性、疾病发生机制以及开发个性化医疗策略提供了强大的工具。然而,单细胞数据的高维度、稀疏性、技术变异性以及批次效应等问题,对细...
大多数生理与病理组织都展现出高度的细胞异质性。深入解读异质细胞谱图并精准鉴定关键细胞亚型，对于理解组织发育、功能、细胞间相互作用及其微环境，以及疾病动态发展等生理与病理过程，都具有至关重要的价值。目前，主流的细胞异质性分析方法主要基于单细胞转录组数据，通过基因表达谱信息来定义细胞类群，并绘制了众多复杂...
单细胞转录组之所以可以进行细胞异质性分析,其中一个重要原因便是文库构建时对细胞的无差别捕获,在最终获得的测序数据中几乎包含了组织中所有细胞类型。所以,对目标亚群进行再分群是细胞异质性分析的重要内容。 文章的主要研究对象是神经细胞,所以分别对兴奋性神经元和抑制性神经元进行再分群,分别获得了15个细胞亚群。这...
单细胞转录组定义的人类骨髓和血液自然杀伤细胞的异质性 一、 研究背景 自然杀伤(NK)细胞是1型先天淋巴样细胞(ILCs),能通过发挥细胞毒性和产生细胞因子来对抗病毒感染,但其发育过程,转录组状态和异质性未有明确定义。根据CD56表达,可将NK细胞分为CD56 bright和CD56 dim两个亚群,而CD56 dim细胞基于CD57被进一步划分。
肿瘤细胞异质性是指同一恶性肿瘤内存在不同的细胞亚群,这些细胞亚群在形态、功能和分子特征上存在差异。肿瘤细胞异质性是导致肿瘤对治疗耐药性、复发和转移等问题的主要原因之一。因此,深入了解肿瘤细胞异质性,对于设计更有效的治疗策略具有重要意义。 二、分析方法 1.单细胞测序技术 单细胞测序技术是研究肿瘤细胞异质性...
细胞异质性(单细胞技术)单细胞分析方法显示在FMDV感染过程中,细胞与细胞间在病毒RNA水平上存在很大的差异性为了研究在FMDV复制过程中的细胞异质性,我们应用单细胞方法分析被感染的细胞(图1-1)。首先用0.0001/0.001moi FMDV感染群体BHK-21细胞,感染24h后,胰酶消化细胞,通过FACS分选被感染的单细胞,反复冻融裂解细胞,获...
1、人类自然杀伤细胞异质性的高维单细胞分析 High-dimensional single-cell analysis of human natural killer cell heterogeneity Nature Immunology; IF: 27.700; DOI: 10.1038/s41590-024-01883-0 内容概要: ① 在最新的科学研究中,自然杀伤(NK)细胞——作为先天淋巴样细胞(ILC)的重要成员,其在免疫系统中的关键作...