染色质免疫沉淀测序 (ChIP-Seq)是一种强大的工具,使研究人员能够研究和了解蛋白质-DNA 相互作用以及它们对基因表达和细胞功能的影响。 ChIP-Seq 分析结合染色质免疫沉淀 (ChIP) 测定和下一代测序 (Seq) 来识别整个基因组中转录因子和其他蛋白质的 DNA 结合位点。 该技术为研究人员提供了对健康状态和各种疾病中发...
技术平台:ChIP-seq、RNA-seq数据分析等 研究摘要: 高温胁迫导致作物雄性不育,从而降低产量。为研究组蛋白修饰在HT条件下对雄性育性的可能贡献,本研究通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)在两个不同品种的陆地棉(Gossypium hirsutum)中绘制了组蛋白H3赖氨酸27三甲基化(H3K27me3)和组蛋白H3-赖氨酸4三甲基化(H3K4me3)...
但文献中只是单单给出一个不同样本ChIP-seq peak数据之间的computeMatrix热图,并没有说明具体的差异以及对差异进行分析。H3K27ac是基因活性的标志,因此它的相关ChIP-seq数据能够帮助识别在DIPG和GBM中活跃的增强子,这些增强子可能参与了肿瘤特定的转录调控。通过分析H3K27ac修饰与基因启动子区域的相互作用,可以预测出DIP...
Cistrome DB(Cistrome Data Browser)数据库收录了人类和小鼠的ChIP-seq数据,包括转录因子、染色质调控因子、组蛋白修饰等五万多个样本数据,是目前公认最全面的ChIP-seq数据库之一。而UCSC Genome Browser是当前业内最有名、应用最广泛的基因组浏览器。今天大师姐就带着大家,尝试用这些网站探索特定修饰的组蛋白是否参与...
本研究采用的微量细胞ChIP-seq技术(LCNChIP-seq),利用约10000个减数分裂前期Ⅰ的水稻花粉母细胞,绘制了全基因组H3K4me3和H3K27me3的组蛋白修饰图谱,两个标记各设置2个生物学重复。分别鉴定出25715个H3K4me3和16414个H3K27me3可重复peaks,其中3598个两种修饰标记同时存在的基因组位点,称为H3K4-K27me3,表明该时期...
Chip-Seq组蛋白修饰实验流程。 1.样品准备。 选择合适的细胞或组织样品。 交联固化染色质,使用甲醛交联染色质,保留组蛋白-DNA相互作用。 2.染色质破碎。 将固化的染色质破碎成小片段,使用超声波或酶切技术将染色质破碎成200-500bp的片段。 3.免疫沉淀。 选择针对特定组蛋白修饰的抗体。 将破碎的染色质与抗体孵育...
ChIP-seq组蛋白特异性修饰位点研究体内蛋白质与DNA相互作用 体内高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点 品牌其他品牌 ChIP-seq组蛋白特异性修饰位点?常见问题 1. Input和IP样本之间的关系是什么? Input和IP属于两个样本,在前期检测、建库、测序都是平行进行的,但是分析中需要将两个样本的测序数据进行整合分析...
锐博生物目前所提供的组蛋白修饰ChIP-seq服务,涵盖以下26种组蛋白修饰形式: 组蛋白修饰形式 服务内容: ChIP: 锐博生物采用国际知名品牌最高质量的ChIP级别抗体,提供前期ChIP实验,确保获得最佳的实验结果; Seq: 采用国际主流新一代测序平台,提供专业的测序及生物信息学分析服务。
组蛋白修饰chipseq和转录因子chipseq区别是形状不同。1、组蛋白修饰chipseq是圆形，点状结合和更长的染色质结构域。2、转录因子结合是棱形，它的特征峰，峰型高，而且窄。
ChIP-Seq是一种将染色质免疫共沉淀与二代测序技术结合起来的组蛋白修饰检测技术。这种技术首先利用特定组蛋白修饰抗体将此类组蛋白修饰结合的DNA区域富集,纯化建库后对此区域进行高通量测序。此技术被认为是全基因组范围内研究组蛋白修饰最好的方法。但是传统的ChIP-Seq需要的百万级的细胞数量才能达到检测要求,而植入前...