2、米仔兰线粒体基因组的基因组成:米仔兰线粒体基因组全长534,321 bp,由35个不同的蛋白质编码基因(PCG)组成(图2A),包括5个ATP合酶基因(atp1、atp4、atp6、atp8 和atp9),4个细胞色素c生物合成基因(ccmB、ccmC、ccmFC和ccmFN),9个NADH脱氢酶基因(nad1、nad2、nad3、nad4、nad4L、nad5、nad6、na...
本发明公开了一种烟草线粒体RNA编辑位点高精度预测方法,下载拟南芥,欧洲油菜和稻三个样本的线粒体全基因组序列,提取位点信息;融合烟草ATP合酶上的atp9,atp6,orf25,orfB,atp1五个目的基因的DNA序列和cDNA序列比对得到的编辑位点数据共同组成数据集;从全基因组中得到负样本;确定最优特征;针对最优特征,对训练集...
RNA编辑广泛存在于植物线粒体和叶绿体中,对植物的生长发育至关重要。RNA C-U编辑是RNA序列中特定的胞嘧啶(C)经过脱氨转变为尿嘧啶(U)的过程,在RNA水平改变了DNA的遗传信息。PPR-DYW类蛋白的PPR结构域负责编辑位点的识别,DYW结构域为提供脱氨酶活性。但PPR-E+和PPR-E类蛋白缺失了DYW结构域,因此虽然能够特异地...
本发明公开了一种烟草线粒体RNA编辑位点高精度预测方法,下载拟南芥、欧洲油菜和稻三个样本的线粒体全基因组序列,提取位点信息;融合烟草ATP合酶上的atp9,atp6,orf25,orfB,atp1五个目的基因的DNA序列和cDNA序列比对得到的编辑位点数据共同组成数据集;从全基因组中得到负样本;确定最优特征;针对最优特征,对训练集...
一种烟草线粒体RNA编辑位点高精度预测方法专利信息由爱企查专利频道提供,一种烟草线粒体RNA编辑位点高精度预测方法说明:本发明公开了一种烟草线粒体RNA编辑位点高精度预测方法,下载拟南芥、欧洲油菜和稻三个样本的线粒...专利查询请上爱企查
本研究以大豆RN型CMS不育系JLCMS9A及其对应的保持系JLCMS9B为材料,比较分析了大豆线粒体基因atpl、atp6、atp9、cOXI1、c0Ⅲ和c0b的编辑位点与CMS的关系。结果表明,在JLCMS9A和JLCMS9B中COXU未发生RNA编辑;atpl、atp9、COXBI和cob基因发生的RNA编辑与CMS无关;而atp6基因在JLCMS9A中比JLCMS9B多3个编辑位点,...
本发明公开了一种烟草线粒体RNA编辑位点高精度预测方法,下载拟南芥,欧洲油菜和稻三个样本的线粒体全基因组序列,提取位点信息;融合烟草ATP合酶上的atp9,atp6,orf25,orfB,atp1五个目的基因的DNA序列和cDNA序列比对得到的编辑位点数据共同组成数据集;从全基因组中得到负样本;确定最优特征;针对最优特征,对训练集...
对甜菜线粒体atp6基因转录本的RNA编辑位点进行了研究.结果表明,atp6基因转录本的保守区域共有8个编辑位点,均发生在密码子的第一、二位点上,这些位点的编辑将导致氨基酸种类的变化,如第二个编辑位点上发生的由丝氨酸(疏水参数0.8)到亮氨酸(疏水参数3.8)的转变.通过分析可看出atp6基因RNA编辑有着改变蛋白质疏水性的...