国自然爆点!山东大学又水灵灵的发一区了:基于“RNA测序与生信分析”的线粒体稳态研究,体内外实验锦上添花!#科研 #博士 #生物信息学 #SCI #医生
这项研究通过超深度线粒体RNA测序,首次为人们展示了线粒体RNA编辑的多变程度,文章发表在本周的Science杂志上。 “线粒体在细胞中负责生产能量,细胞需要的能量越多(例如肌肉细胞),它拥有的线粒体就越多。线粒体拥有自己的一套遗传物质,即使在同一个体内,线粒体基因组也存在显著的多样性,”文章的第一作者Alan ...
该研究团队以脂肪细胞来源的具有线粒体靶向性的细胞器脂滴(lipid droplet, LD)作为生物源性载体,通过RNA测序分析证明线粒体靶向SDT可以抑制胰腺癌细胞中的线粒体电子传递链,导致胰腺癌组织中多个线粒体电子传递链相关的基因表达下调,如线...
本次会议中提及的NGS的新突破点包括毒性、RNA-Seq文库及可变剪接图谱中的多余转录组的去除以及线粒体DNA测序。如今NGS在线粒体DNA测序领域取得了一定的进展,线粒体在疾病发展中的作用逐渐被认识,然而这些细胞器中的DNA测序十分复杂,因为线粒体具有相当大的遗传复杂性和异质性。NGS的另一个突破点为肿瘤异质...
单细胞测序样本制备仪,基于Drop-seq技术*,完成高通量的单细胞mRNA 3’端测序。 已经对数千个线粒体基因组进行了测序,但可用的线粒体转录组相对较少。这可能很快就会改变。高通量RNA测序(RNA-Seq)技术使得生成大量线粒体转录组数据变得快速而廉价。在这里,我们探索RNA-Seq用于组装线粒体基因组和研究它们的表达模式...
单细胞测序样本制备仪,基于Drop-seq技术*,完成高通量的单细胞mRNA 3’端测序。 已经对数千个线粒体基因组进行了测序,但可用的线粒体转录组相对较少。这可能很快就会改变。高通量RNA测序(RNA-Seq)技术使得生成大量线粒体转录组数据变得快速而廉价。在这里,我们探索RNA-Seq用于组装线粒体基因组和研究它们的表达模式...
单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析中的质量控制(QC)是一个至关重要的步骤,旨在去除低质量的细胞,避免数据解读中的误差。其中,线粒体比例(mtDNA%)是QC中的重要指标,用于筛选出低质量的细胞。早期的研究为此设定了5%的mtDNA%阈值,这一阈值随后成为多个scRNA-seq分析软件的默认标准,并在众多研究中被广泛采用。然而,...
你可以先将线粒体收集，再进行测序比较好。要不然数据可能会被核基因组覆盖。
你可以先将说搞线粒体收集，再进行测序比较好。要不然数据可能会被核基因组覆盖。
2021年9月10-12日,由国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院、福棠儿童医学发展中心共同主办的“2021儿童神经系统疾病诊疗进展学习班”上,赛福基因特邀首都医科大学附属北京儿童医院方方教授以《RNA测序在线粒体病及罕见病应用的文献学习》为题做了学术主题分享。