单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析中的质量控制(QC)是一个至关重要的步骤,旨在去除低质量的细胞,避免数据解读中的误差。其中,线粒体比例(mtDNA%)是QC中的重要指标,用于筛选出低质量的细胞。早期的研究为此设定了5%的mtDNA%阈值,这一阈值随后成为多个scRNA-seq分析软件的默认标准,并在众多研究中被广泛采用。然而,...
1. 🔥 Cell:基于细菌液滴的单细胞RNA-seq揭示抗生素相关的异质细胞状态。 文献标题:Bacterial droplet-based single-cell RNA-seq reveals antibiotic-associated heterogeneous cellular states 文献来源:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)00002-8 ▲研究概览 2. Science:线粒体代谢决定了神经元...
线粒体自噬是受损线粒体的选择降解,以维持细胞稳态,这已被证明具有促肿瘤和抗肿瘤作用。本研究结合单细胞测序数据和转录组学筛选与GC进展相关的线粒体自噬相关基因(MRG)并分析其临床价值。逆转录定量PCR(RT-qPCR)和免疫化学(IHC)进一步验证了基因表达谱。在获取单细胞测序数据和MRGs的交叉后,共鉴定出18个DE-MRGs...