5. 单细胞RNA-seq的数据挖掘 单细胞 RNA-seq 为我们了解组织的组成等提供非常好的工具,而单细胞测序的效果也取决于我们到底测多少细胞,一般而言几百个细胞的单细胞测序不仅仅捕获常见的细胞成分,也会捕获稀少类型的细胞。由于 RNA 降解,细胞的凋亡和实验误差等原因,一些数据将会被排除,不纳入数据分析环节,因此初始...
单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术已成为解开单个细胞内RNA转录物的异质性和复杂性,以及揭示高度组织化组织/器官/生物体内不同细胞类型和功能的组成的最先进方法。通过单细胞RNA测序,现在可以在一项研究中分析超过数百万个细胞的单细胞水平的转录组。这使我们能够在转录组水平上对每个细胞进行分类、表征和区分,从而识别出...
什么是单细胞 RNA 测序(scRNA-Seq)数据? 单细胞 RNA 测序(single-cell RNA seq,scRNA-Seq)是一种用于分析单个细胞中基因表达水平的技术。即可以在单个细胞的水平上检测 RNA 表达。传统的 RNA 测序( Bulk RNA-Seq)方法只能测量样本整体的表达水平,而不能反映细胞间的异质性。
近几十年来,越来越多的研究使用RNA-seq数据探索了肺癌的潜在预后标志物,并提高了我们对肿瘤发生和进展的理解,但这些预后特征是基于RNA-seq数据,它无法检测肿瘤样本中确切的细胞和分子变化。单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够在单细胞水...
不同于传统RNA测序(RNA-Seq)对细胞群进行的批量采样,高灵敏度的单细胞RNA 测序(scRNA-seq)法可帮助研究人员探索复杂组织中单个细胞的不同生物学特性,了解细胞亚群对环境要素的反应。这些检测方法有助于研究细胞功能和细胞分化、增殖、肿瘤发生等一系列与时间有关的生物过程异质性。
单细胞 RNA 测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是一种在单细胞水平上利用 RNA 测序对特细胞群体进行基因表达谱定量的高通量实验技术。待测组织经过单细胞分离、RNA 提取、逆转录、文库构建和测序,便可利用数据分析获得多个细胞的基因表达谱。 1.单细胞测序与普通转录组测序的区别 ...
单细胞RNA测序,通常简称为scRNA-seq。这项技术使研究人员能够深入了解单个细胞的基因表达模式,揭示了生物体内的细胞异质性和功能多样性。
虽然Bulk RNA-seq 可以探索不同条件(例如治疗或疾病)之间基因表达的差异,但无法充分捕获到细胞水平的差异。例如,在下图中,如果进行Bulk分析(左),我们将无法检测到基因 A 和基因 B 表达之间的正确关联。但是,如果我们按细胞类型或细胞状态对细胞进行正确分组,我们可以看到基因之间的正确关联。
这两种技术的主要区别在于它们的样本制备方法。在开展scRNA-seq分析时,您需要分离整个细胞,这样才能捕获和分析细胞内的RNA。与此不同,snRNA-seq只需分离出细胞核,重点是捕获和分析细胞核内的RNA。 Bio-Techne的现场应用科学家Alberim Kurtishi博士解释说,尽管存在差异,但scRNA-seq和snRNA-seq在测序时覆盖的基因数量...