简并引物是根据蛋白质氨基酸序列设计的包含多个碱基组合的引物群,用于扩增未知DNA。一般原则:1.密码子使用频率优先;2.减少简并度(如3'端少简并);3.引物长度18-30bp;4.Tm值相近;5.避免二级结构。 **问题拆分**:需明确定义及设计原则两部分内容。 **知识提取**: 1. **定义**:简并引物基于氨基酸反向翻译设计,因密码子简...
所谓简并引物是指根据肽链的氨基酸序列(或部分序列),并充分考虑密码子的简并性而设计的、用于 PCR 扩增的混合引物群体,这种混合引物之间具有不同的碱基组成,但碱基的数量是相同的。由于充分考虑了密码的简并性,在这种混合引物中必定有一种引物是可以和该基因的 DNA序列精确互补。 根据肽链的氨基酸序列(或部分序列)...
简并引物是指用来编码一段短肽序列的不同碱基序列的混合物。主要用来同源克隆未知的基因,或用来分析某一种基因多态性的一种方法。简并引物设计的常见程序如下:1.利用NCBI搜索不同物种中同一目的基因的蛋白或cDNA编码的氨基酸序列。 因为密码子的关系,不同的核酸序列可能表达的氨基酸序列是相同的,所以氨基酸序列才是真...
简并引物是一组具有部分序列差异但具有相似特性的引物序列,用于扩增目标DNA序列。简并引物通常由多个互补碱基序列组成,这些引物序列可以与目标DNA序列的多个可能序列匹配。简并引物的广泛应用促进了分子生物学研究的发展,并在基因组学、遗传学和医学诊断中扮演着重要的角色。 简并引物的设计原理 简并引物的设计原理基于...
简并引物通俗的讲是不完全相同的引物序列的混合物。使用简并引物是为了增强引物的通用性,即不同DNA序列的目的基因都可以用这种引物进行PCR扩增。 其定义是为了获得序列未完全清楚的核酸的一种引物设计方案,特点是所设计的引物序列某位置的核苷酸可以分别是两个或两个以上不同的碱基,结果所合成的引物是该位置上不同序...
解析 答:所谓简并引物是指根据肽链的氨基酸序列(或部分序列),并充分 考虑密码子的简并性而设计的、 用于PCR扩增的混合引物群体,这种混合引物之间具有不同的碱基组 成,但碱基的数量是相同的。由 于充分考虑了密码的简并性,在这种混合引物中必定有一种引物是可 以和该基因的DNA序列精确互 补。
CTTGGAGT(C/T/G)AA(G/A)AACATGTG,查询简并碱基代码表(下图),可知 C/T/G=B, G/A=R,简并度=3 ×2 =6,整理后 3′端序列为 CTTGGAGTBAARAACATGTG,故而需要合成的 3′端引物序列:CACATGTTYTTVACTCCAAG(与原序列是反向互补关系)。 3. 质量评估 ...
简并引物名词解释 简并引物名词解释 简并引物是一种用于PCR扩增反应的引物。引物是分子生物学中的一种寡核 苷酸序列，能够与特定DNA序列互补结合，从而对该DNA进行扩增。PCR是一 种常用的分子生物学技术，可以在极短的时间内扩增一份DNA样本中的特定序列，从而可以对该序列进行进一步研究。简并引物是一种包含多种...
设计简并引物的核心思路是通过处理序列变异平衡扩增效率与特异性。首先确定多序列比对后的高度保守区域作为靶区,规避突变热点。针对密码子第三位的冗余性(如丝氨酸的UCN与AGY类型需区别处理),通常只在第三位设置简并碱基(如N/R/Y)。引物长度需保证Tm值适宜(计算公式考虑简并碱基比例),为防止延伸受阻严格避免3'端...
简并引物，作为PCR实验中的关键角色，其设计涉及到多个层面的考量。简而言之，简并引物就是一组能够代表编码单个氨基酸所有不同碱基可能性的序列混合物。由于密码子的简并性，单纯依据氨基酸顺序推测编码的DNA序列往往不够精确。然而，通过巧妙设计成对的简并引物，我们可以有效地扩增出所有编码已知氨基酸顺序的核酸序列...