空间转录组测序:将组织切片与转录组测序结合,实现空间信息和转录本信息的获取,是一种以空间的维度分析和描述特定细胞类型的表达谱,来了解器官、组织和病理状态之间的表达差异的技术 。相比于单细胞转录组,它…
以下是空间转录组测序的一般流程: 1.样本制备: 从组织样本中提取RNA。 对RNA进行质量检测和定量。 2.文库构建: 使用反转录酶将RNA转化为cDNA。 在cDNA两端添加接头序列。 通过PCR扩增cDNA片段,构建测序文库。 3.空间转录组捕获: 将组织样本切片,并固定在载玻片上。 使用特定的探针或抗体标记细胞或组织区域。
空间转录组测序的工作流程由多个关键步骤组成。首先，样本的收集与组织切片制备至关重要，以确保后续实验数据的准确空间定位。显微镜下对切片进行精确标记，确保实验数据的空间准确性。随后，加入特定探针并进行RNA捕获与扩增。通过高通量测序技术，实现对提取总RNA的深度测序，获取每个位置的转录组信息。在数据...
对组织切片进行染色,使用 Visium试剂生成添加条形码、空间感知的全转录组文库。在Illumina生产规模的测序系统上对文库进行测序, 如 NovaSeq™ 6000、NextSeq™ 2000、NextSeq™ 100或NextSeq™ 550系统。使用 Space Ranger 流程(10x Genomics)进行数据分析,借助...
空间转录组流程是一种高通量的基因表达分析技术,可以同时检测 数千个基因的表达水平。该技术的流程包括样品准备、RNA 提取、 RNA 质量检测、RNA 文库构建、高通量测序和数据分析等步骤。 样品准备是空间转录组流程的第一步。样品可以是细胞、组织或者 生物体的某个部位。在样品准备过程中,需要注意避免 RNA 的降解 ...
一般来说,单细胞空间转录组测序实验流程包括以下几个主要步骤: 1. 细胞分离和捕获 对要研究的组织进行细胞分离,并使用微流控芯片或其他技术进行单细胞的捕获和固定。 2. RNA提取和测序库构建 对捕获到的单细胞进行RNA的提取和测序库的构建。这一步是整个实验的关键,需要选择合适的材料和试剂,并严格按照操作规程进...
单细胞转录组测序流程 单细胞转录组测序是一种高通量的技术,可以对单个细胞的基因表 达进行测量。这种技术可以帮助我们了解细胞的异质性,发现新的 细胞类型和亚型,以及研究细胞发育和疾病的机制。下面是单细胞 转录组测序的流程。 1. 单细胞分离 需要将单个细胞从组织或细胞混合物中分离出来。这可以通过机械 分离、...
一种空间转录组测序数据的分析方法,包括如下过程: s1、样本检测建库; s2、测序数据的生物信息分析。 优选地,步骤s1包括如下过程: (1)样本准备:将组织速冻后,使用oct包埋剂对组织进行包埋,在低温环境(一般为-10℃,组织不同,上、下微有浮动)下,使用冷冻切片技术从组织块上切取一张长、宽各10mm,10μm厚的切片...
29、根据本发明的实施例,所述空间转录组学测序是通过如下方式进行的:将所述待测组织样本与所述芯片上的靶向探针和/或poly-t探针进行接触处理;将接触处理产物依次进行组织固定处理和组织透化处理;将组织透化处理产物依次进行逆转录处理和rna变性移除处理;将rna变性移除处理产物依次进行第二链延伸反应和洗脱处理,以便得到...
空间转录组测序:将组织切片与转录组测序结合,实现空间信息和转录本信息的获取,是一种以空间的维度分析和描述特定细胞类型的表达谱,来了解器官、组织和病理状态之间的表达差异的技术 。相比于单细胞转录组,它提供了空间位置信息,为疾病研究提供更精准的研究方向,对深入理解疾病致病机理以及靶向治疗具有重要意义。