前些天在《生信技能树》公众号提到了一个开放式讨论:富集分析排名第一的通路就是目标吗,因为干扰基因前后差异分析很容易得到成百上千个上下调基因,它们去做生物学功能数据库注释,也很容易得到几十条甚至上百个通路。 所以转录组差异分析不足以说明你的目标基因调控某个通路,哪怕是这个通路排名如何的靠前也不过是一个统计学指标罢了。比如文章:《Targeting
前些天在《生信技能树》公众号提到了一个开放式讨论:富集分析排名第一的通路就是目标吗,因为干扰基因前后差异分析很容易得到成百上千个上下调基因,它们去做生物学功能数据库注释,也很容易得到几十条甚至上百个通路。 所以转录组差异分析不足以说明你的目标基因调控某个通路,哪怕是这个通路排名如何的靠前也不过是...
同时也发现ABC增强子调控的目标基因则具有一定的肿瘤分子特征,与多个肿瘤细胞信号通路、突变负荷和肿瘤免疫微环境密切相关,提示ABC调控的目标基因具备一定临床转化价值和药物靶标潜力。值得一提的是,相较于其他方法,如基于遗传位点位置分布、eQTL统计学数量关系、增强子活性与基因表达相关性以及染色质交互频率,ABC模型在有效...
再次强调,这样的方法也同样适用于转录因子、染色质调控因子等蛋白与目标基因结合情况的分析。比起基于序列的转录因子预测,这种基于ChIP实验的seq数据,在最后的实验验证中,阳性率会更高,提示作用也更强。但是,大数据毕竟是大数据,依然不能直接明确分子间的真实互作关系。想发高分文章,记得一定要补充ChIP实验验证哦! 查看...
进一步地,研究者利用该模型系统绘制出中国人群结直肠癌的增强子-目标基因映射图谱,高通量鉴定出超过34,130个增强子-基因调控对,涉及15,121个增强子元件和12,351个目标基因。随后,研究者通过大规模、多中心的人群流行病学研究:首先在包括17,789例病例和19,951例对照的大规模人群中,系统地筛选了与结直肠癌人群易感性...
该研究以蛋白翻译调控元件—Kozak序列为切入点,开发出一种全新的、普适的策略,用于精细调控目标基因蛋白表达水平。这种策略在不触及基因转录的情况下,既能实现蛋白表达水平的双向(上调或下调)调控,又能将蛋白表达水平控制在预测范围内。 基因...
目前应用最广泛的基因沉默方法包括CRISPR/Cas、RNAi、CRISPRi等技术,但由于其特性,难以实现对目标基因的可预测精细微调。大规模启动子突变虽然能将目标基因的表达调整到不同水平,但具有随机性,需要耗费大量的人力物力。因此,有必要对基因调控技术进行拓展和优化。
p53振子的形成机制及microRNA对p53目标基因表达的精细调控
解析 基因敲除技术是通过人为干预基因的表达,使目标基因在特定生物体中失去功能,以研究其功能和调控机制。 题目给出的是一个完整的基因敲除技术的定义,内容涵盖了技术手段(人为干预)、目的(使目标基因失活)及研究目标(功能与调控机制),概念逻辑清晰,无需补充或修正,可直接作为答案。因此直接提取原句作为答案。
公司自主开发的“Dr.Tom多组学数据挖掘系统”是一款可以快速、深度地挖掘基因、蛋白和代谢数据的系统,能够在复杂的多组学数据中快速找到目标基因和相关基因调控通路。该系统整合了多个国际常用的基因数据库和生物信息分析工具,并优化了数据挖掘的方式和展现形式,还结合了云计算、人工智能和机器学习技术。通过该系统,科研...