测序策略:10×平台,单细胞测序(scRNA-seq) 捕获细胞数:72,693个细胞 结论:成纤维细胞是唯一必需的能招募和激活自体活性CD8+ T细胞的皮肤细胞;不同部位成纤维细胞对IFN-γ的响应能力决定其招募CD8+ T细胞的能力,并决定白癜风的发病位置偏好。 案例六 皮肤的单细胞转录组...
在单细胞测序应用领域，研究者往往需要对皮肤组织内的不同细胞亚群进行分类，并在不同疾病模型下定位靶细胞，同时在进行肿瘤类研究时（如黑色素瘤和鳞状细胞癌等）也需要对肿瘤亚型及细胞的识别。只有制备高质量的单细胞悬液才能保证下游实验的顺利进行，但是常规手工解离皮肤组织，不但费时，且获得的细胞悬液碎片高，...
单细胞测序是拆解“疾病黑箱”的新兴技术手段: 在单细胞和多细胞生物中,单个细胞之间的差异可能引起深远的后果,即使来自看似同质的群体,单个细胞在基因表达和蛋白质水平上也可能表现出显著差异。单细胞基因组测序技术可以弥补传统的整体基因组测序方法的缺陷,从而对这些复杂和多样化的生物现象进行高度特异性的研究[3]。
在单细胞测序应用领域,研究者往往需要对皮肤组织内的不同细胞亚群进行分类,并在不同疾病模型下定位靶细胞,同时在进行肿瘤类研究时(如黑色素瘤和鳞状细胞癌等)也需要对肿瘤亚型及细胞的识别。 只有制备高质量的单细胞悬液才能保证下游实验的顺利进行,但是常规手工解离皮肤组织,不但费时,且获得的细胞悬液碎片高,产量低...
单细胞分析结果反映了患者在抗原提呈和抗菌作用方面的免疫缺陷。本研究的局限性在于CMC病例数量较少，未来需要加大样本量的研究来揭示患者之间的差异，此外，后续还可以通过细胞或动物实验对单细胞测序的结果进行验证。详细技术请访问欧易生物官网 ⬇ 百度搜索欧易生物（oebiotech）⬇ 了解更多多组学技术 （单细胞测序、...
文章主要对小鼠背部皮肤伤口中的细胞进行单细胞测序(10X Genomics),对其中的fibroblast进行分群,发现其中一群fibroblast表达hematopoietic markers。对其进行单细胞western blot和单细胞全长测序(Fluidigm公司的C1™)分析以及一些生物学实验验证,发现hematopoietic lineage cells 可以分化成一部分的myofibroblast。
1. 单细胞分析揭示创伤皮肤细胞的异质性 对损伤2周的皮肤组织进行单细胞测序分析(Fig. 1a),共捕获22,322个细胞,质控后剩余21,819个细胞用于后续分析。降维聚类后共得到13个cluster,通过marker基因鉴定,判断细胞类型包括成纤维细胞、髓系细胞、T细胞、B细胞、雪旺细胞、红细胞、树突细胞和淋巴内皮细胞,其中成纤维细...
图4皮肤组织含有细胞分类及cell marker数 通过上述解离方案,在完成皮肤样本的单细胞悬液后,运用10xGenomics单细胞3’转录组测序,测得相应原始数据,结合图1实际样本状态及皮肤组织不同部分应含有的细胞类型,通过图4中的cell marker进行细胞类型鉴定,最终得到图5实际样本...
瑞沃德单细胞悬液制备仪,通过组织处理管机械剪切,配合酶解试剂盒和内置的处理程序及温控系统,只需将样本放入,设好程序,即可轻松获得高质量皮肤单细胞悬液,获得的细胞可直接用于后续实验,如单细胞测序、原代细胞培养、细胞分选等。 有了高质量的单细胞悬液后,高效稳定且高性价比的单细胞测序平台将保障下游实验结果的质...
近年来,单细胞RNA测序(scRNA-seq)提高了我们对皮肤生物学的理解。但对新鲜样本的需求、不完全解离导致的细胞损失或死亡,以及组织消化过程中的刺激作用都使scRNA-seq的实用性受到了限制。而单核RNA测序(snRNA-seq)可以应用于冷冻的、难以解离的样本,这或许是可以绕过scRNA-seq对皮肤组织限制的一个途径。