点击alignment spot view, 放大之后可以看到每个点的情况,绿色是有数据,红色是缺失数据 点击一个点后可以看到这个物质的详细信息,上方的条形图显示每组的情况 点中一个点,选择手动查找 修改tolerance的值,再进行查找,对比峰图,进行鉴定,再选择是确信的,存疑的还是未知的。 右键可以导出MRMPROBS的格式,进行靶向的分析。
用MS-DIAL分析代谢组数据 今天分享的是使用MS-DIAL分析代谢组数据: 操作步骤 运行AnalysisBaseFileConverter 把要转换的文件拖进来,点击转换 打开软件 创建新项目 选择LC/MS,DIA,选择窗口文件,选择离子模式,选择代谢组学 窗口文件 设置分组,blank与QC样品 设置保留时间与MZ范围 选择smoothing等级,选择峰宽与峰高,选择...
MS-DIAL was launched as a universal program for untargeted metabolomics that supports multiple instruments
1、可以直接从MSDIAL官网下载数据库。 (链接:http://prime.psc.riken.jp/compms/msdial/main.html#MSP) 2、可以直接从mona数据库下载MSP格式数据库。 3、可以整理自己的代谢数据库。 公共数据库,存在不同仪器采集的数据,不同仪器所用碰撞能不一样,产生的质谱二级谱图本身也有差异。另外数据库中还存在着一些理...
在非靶向代谢组学中,LC-全扫描方法主要用于获得每个样品中所有代谢物特征的准确质量/电荷比(m/z)和相对丰度。所有样品的原始数据使用MS仪器供应商的数据处理软件、商业软件或免费资源(例如XCMS、质谱-数据非依赖性分析[MS-DIAL]、MZmine 2等)进行进...
软件解压后,找到MSDIAL.exe双击打开 软件界面如下,示例软件版本为3.98,不影响查看数据使用: 二、打开搜库结果 搜库结果为使用msdial分析完,我司会提供。用户收到搜库解压后,即可通过MSDIAL打开。 打开工程文件: 找到搜库保存路径,打开结果 打开后界面如下: 三、查看单一物质结果 选择要查看的样品,双击打开 方框内显示...
同一期刊连发4篇，鹿明LC-MS非靶向代谢“大有可观”，很多老师对于LC-MS平台测下来的数据搜库及分析比较感兴趣，本期小鹿分享LC-MS常用的代谢物谱图库有METLIN、MassBank、mzCloud、HMDB、KEGG、MetaCyc、Lipidmaps、MS-Dial等；助力您代谢组学的研究！！mzCloud数据库 mzCloud数据库由Thermo 公司隆重推出的云端质谱...
ChromaTOF、AnalyzerPro、XCMS、MZmine 2和MS-Dial等都可以用于分析GC-MS的下机数据,但是需要将原始数据转换为软件要求的格式。 相关服务: 代谢组学 提交需求 姓名* 联系类型 * 请选择手机电子邮箱qq微信 联系方式 * 项目描述 咨询项目 * 提交需求 How to order?
19.3、利用全扫描模式检测不同作物挥发物,所得数据利用msdial软件进行解卷积,比对nist17数据库进行定性; 20.4、将所检测物质进行整合,手动去掉重复物质,在不同电压下,利用产物离子模式检测去重后各物质前体离子的产物离子,根据结果选择合适的碰撞电压; 21.5、利用所得物质离子对建立标签代谢数据库; ...
同一期刊连发4篇,鹿明LC-MS非靶向代谢“大有可观”,很多老师对于LC-MS平台测下来的数据搜库及分析比较感兴趣,本期小鹿分享LC-MS常用的代谢物谱图库有METLIN、MassBank、mzCloud、HMDB、KEGG、MetaCyc、Lipidmaps、MS-Dial等;助力您代谢组学的研究!! mzCloud数据库...