基于已发表的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,采用双向双样本孟德尔随机化(MR)分析评估了肠道微生物群组成与脓毒症之间的关联,并进行敏感性分析以验证结果的稳健性。整合GWAS和表达数量性状位点(eQTL)数据对IV SNPs和暴露基因进行了MR分析,以确定关键基因。针对关键基因进行功能富集分析,利用单细胞数据集分析关键基...
生信分析通过对基因组、转录组、蛋白质组等数据的分析,可以帮助我们找到疾病的生物标志物,揭示疾病的发生机制,为精准医疗提供有力的支持。 而孟德尔随机化呢,则像是一个公正的裁判,它利用遗传学数据来推断因果关系,避免了传统观察性研究中混杂因素和反向因果关系的干扰。就像是在一场比赛中,孟德尔随机化能够确保评判的...
在此,作者使用了一种基于多组学的孟德尔随机化(SMR)方法来确定CD中OS基因的假定因果效应和潜在机制。 1. CD和HCC患者OS基因差异表达的Meta分析 为了了解OS基因在CD中的作用,共纳入了六个基因表达数据集(三个微阵列数据集和三个RNA-seq数据集),以比较CD患者肠道组织中的RNA表达(n = 704)和HC(n = ...
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真龙的传人16 赤脚医生 3 生信系列之孟德尔随机化分析,发sci杠杠的,具体数据、作图由本人提供,现缺写背景、讨论的同学,和论文排版熟悉sci投稿流程的同学,有意愿的同学可以私聊我登录百度帐号 下次自动登录 忘记密码? 扫二维码下载贴吧客户端 下载贴吧APP看高清直播、视频! 贴吧页面意见反馈 违规贴吧举报反馈通道 贴...
在标准化微阵列结果之后(图3A、B),识别出SLE和乳腺癌相关数据集之间的447个共同差异表达基因(图3C)。通过聚类,WGCNA(软阈值功率=6)进一步去除了灰色模块中的61个明显异常值,并识别出386个感兴趣的关键基因(图3D、E)。 功能特性分析 为了进一步了解乳腺癌中386个SLE-DEGs的潜在功能,作者进行了GO和KEGG富集分析。
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BTC中PRGs的遗传变异性为了揭示PANoptosis相关基因(PRGs)在胆道癌(BTC)中的遗传变异性和差异表达。 总结这篇研究旨在通过多组学数据分析,探索PANoptosis相关基因(PRGs)在胆…: 而孟德尔随机化呢,则像是一个公正的裁判,它利用遗传学数据来推断因果关系,避免了传统
Meta秘籍,第二讲文献检索:Embase和Cochrane 芒果学长以复现一篇Meta文献为例,手把手带你掌握Meta分析秘籍。上期用pubmed检索文献学会了吗?本期学长将教大家如何使用Embase和Cochrane进行文献检索,手把手教大家下载文献!跟上学长的步伐,从Meta小白变成大佬的机会来了!想发Meta,生信,孟德尔随机化,文章,欢迎看主页dd学长～...