用好工具为你的文章增光添彩在我们整理实验数据或是生信数据时常常需要将数据可视化,变成易于理解和传达的图表,从而更好地展示和解释研究结果。 提到数据可视化大家往往会想到R语言,但并不是每个人都会代码并且…
韦恩图是一张生信分析常用的图形,通过下面的在线工具,无需自己动手写代码,可以快速创建韦恩图。 在线绘制四韦恩图工具 在线绘制六韦恩图工具 韦恩图在线绘制工具 基因功能注释 DAVID在线工具 DAVID是一个免费的基因功能注释工具,可以帮助研究人员了解基因的功能和通路。上传基因列表,可进行功能注释和通路分析。 DAVID页...
补充:生信分析软件有很多,但是常用的几个软件包括R、Python、Qiime和Mothur。这些软件都具有广泛的功能,可以进行各种生信分析。R语言是一门统计语言,可以用于生信分析。主要用于结构化数据、生物信息学数据和其他数值数据的分析。Python也可以用于生信分析。具有广泛的库和工具,可以进行各种不同类型的生信分析。Qiime是一个...
GEPIA2主要有两大功能:Expression Analysis和Custom Data Analysis。在Expression Analysis中以RNA-seq表达量信息为主可以进行八大类分析,而Custom Data Analysis则支持上传本地癌症RNA-seq数据与TCGA和GTEx的样本进行比较。 不会代码的小白,完全可以用这个数据库轻松解决肿瘤方向基因表达和预后。 GEPIA2的主要功能: 肿瘤类...
ngs-bits - Short-read sequencing tools - 短reasd测序工具 一个强大的工具集,安装后直接使用。 # conda安装指定版本, 安装高版本失败,故采用2021_09版本# conda python版本3.9conda install ngs-bits=2021_09 -y# 测试安装是否成功,成功则显示下列内容ReadQC ...
在线工具一般具有“操作简单、无需安装、用完就走”的特点,轻松实现用别人的服务器分析自己的数据。下面就为大家分享17个实用的小工具,感兴趣的小伙伴可以试试呀! 1. GO、KEGG富集分析工具 OmicShare的GO、KEGG富集分析工具非常强大,只需上传目的基因文件,即可进行常见物种的GO、KEGG富集分析。分析结果中,直接包含数据...
①BioXFinder国内第一个也是一个生物信息数据库，集成了BLAST、生存分析、基因ID转换等生信分析工具。汇集了核酸、蛋白、蛋白结构、代谢通路和信号通路信息，可高效的搜寻到自己想要的信息（中英双文），并且在无代码的情况下完成生信分析。生存分析图功能说明 研究某癌症类型中患者的生存情况 研究biomarker在癌症中的预后...
那没有编程基础咋办?今天就给大家分享10个好用的TCGA在线工具,帮助一站式完成分析绘图,无代码新手友好。 1. cBioPortal 数据库链接: http://www.cbioportal.org/ 一个功能超强的综合型公共组学资源探索数据库。谷歌学术相关搜索28000+,两篇核心论文引用累积20000+。你可以使用cBioPortal: ...
相关性分析是生信分析过程中出现频率非常高的分析方法,涉及到pearson相关性或spearman相关性等算法。涉及到相关性分析的场景,有以下几种 1 VS 1相关性比较:例如两个基因之间的相关性分析 1 vs 多相关性比较:例如一个基因和多个基因的表达值之间的关系。
首先非常感谢CJ老师开发的TBtools工具,给生信分析带来了极大的便利,详细内容介绍请参考https://www.jianshu.com/p/... 1.6 花舞lala 35 49 RNA-seq数据分析工具详细介绍(从质量控制到可视化) Methods and tools for RNA-seq-based co-expression network analysis 非常全面,... 0.5 Y大宽 0 20 WGCNA关键模...