因此,为了确定在水稻条纹病毒感染过程中可能发挥关键调节作用的转录因子,作者使用ATAC-seq中确定的上游基序在DEG数据中搜索转录因子,共发现34个转录因子。为了进一步验证RNA-seq中这些转录因子的转录变化,作者选择了8个已被报道与水稻生物胁迫有关的基因(OsWRKY77、OsERF91、OsWRKY45、OsWRKY28、OsJAMYB、OsWRKY12、Os...
期刊名称:Mol Plant Microbe Interact 期刊IF:4.171 项目材料:水稻稻曲病菌 爱基提供技术服务:ATAC-seq 合作单位:华中农业大学植物病理学湖北省重点实验室 Title(E) ATAC-seq Data for Genome-Wide Profiling of Transcription Factor Binding 2 Sites in the Rice False Smut Fungus Ustilaginoidea virens 们...
在诸多性状上优于双亲的现象,称为杂种优势.作为植物界的一种重要现象,杂种优势早已在作物育种中广泛应用,极大提升了作物产量,然而目前对杂种优势形成的分子机制仍缺乏系统认识.籼稻(indica)是亚洲栽培稻的主要亚种,占全球水稻产量的70%左右,其两个主要亚群(indicaⅠ和indicaⅡ)之间的强杂种优势为杂交水稻育种提供了...