混合样本测序一般是选择表型极端或目标性状差异的个体混合,构建一个文库进行测序。 原理: 假设每个样本被测到的概率相等,通过测序reads数计算等位基因频率。如果基因与研究性状有关,那么理想情况下,表型差异显著的混合样本中,该基因等位基因频率差异显著。 不足: 大群体的等位基因频率才能代表该群体真实的情况,选择少量样...
混合样本测序一般是选择表型极端或目标性状差异的个体混合,构建一个文库进行测序。 原理: 假设每个样本被测到的概率相等,通过测序reads数计算等位基因频率。如果基因与研究性状有关,那么理想情况下,表型差异显著的混合样本中,该基因等位基因频率差异显著。 不足: 大群体的等位基因频率才能代表该群体真实的情况,选择少量样...
批次Pooling：将多个样本分为多个批次进行测序。每个批次内的样本进行Pooling，然后分别测序。这种方法可以方...
应用Welch's t-test（Student's t-test变体）比较多个样本。DMR是具有观察到的P值高于预定义β值的Cp...
▪ 扩大了样本范围:能对FFPE细胞和组织,以及PFA固定样本进行单细胞测序分析,而不再受限于是否有新鲜组织可用,可以解锁大量储存在医院以及生物样本库中的 FFPE 样本的宝贵信息。 ▪ 简化了工作流程:FFPE样本比较容易获取,易运输,并且样本收集相对经济成本低。使样本采集更加灵活,实验时间安排更加方便。
利用10xGenomics平台进行单细胞测序的样本,大部分研究者会首选新鲜离体的样本立即消化成单细胞悬液,但这种方式并非对所有组织都适用(见表一),因此需要选择其他样本制备方式:组织抽核,即从组织中直接将细胞核提取出来,制备成单细胞核悬液进行...
客户提供新鲜人全血样本(抗凝管保存),提取 PBMC 细胞悬液后用于单细胞测序。 实验准备: 样本接收,拍照留存,超净台紫外消毒、备好冰盒冰板,准备好生理盐水,Ficoll 试剂 实验步骤: 1. 将新鲜血液转移到 15 ml 离心管中。 2. 将离心管转移至离心机中,配平,室...
一、临床组织样本获得 💠选取临床组织的获取对象需综合考虑饮食、烟酒习惯、药物、生物钟时间规律等多种影响因素。建议实验组样本与对照组样本的采集状态尽量保持一致,以尽可能降低其它未知的因素对于单细胞测序实验结果的影响。 💠建议所取组织块(如原位肿瘤、癌旁组织、转移灶等)尽可能有代表性,尽可能去除组织样本...
生物具有维持生态系统平衡、多样性的重要功能,常用的微生物组测序手段主要是16S/ITS/18S扩增子测序和宏基因组测序。微生物组测序在农业、畜牧业、工业、医学、环境治理、生物能源等各个领域都有广泛的应用,因此涉及的样本种类繁多,不同类型样本的收集方法也各不相同。规范的收集方法以及充足的样本量是保证实验成功的第...