首先,我们需要进入windows的命令行界面(在“应用”里找命令提示符,或者在运行处输入cmd打开)。 在打开的命令提示符界面,输入“blastn”或者“makeblastdb”,如出现以下界面,代表blast安装成功。 Blastn正常界面: makeblastdb正常界面: 如未出现以上界面,或者报错,说明blast安装有问题,请重新回到第一步安装步骤操作。
一、下载Blast安装包 到Blast的官网(https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/)下载你系统对应的安装包,为了防止文件下载出错,你还可以下载对应的MD5文件进行校验。这里我们下载linux版本的(ncbi-blast-2.10.0+-x64-linux.tar.gz)。下载速度看你网速,可以考虑去弄杯咖啡喝(*^_^*) 二、...
看到图4显示说明本地blast已经安装成功。 2.blast+本地数据库的构建 2.1数据的获取 法1:直接从NCBI或者其他数据库网站下载所需序列做成数据库,或者自己已有的测序数据(格式必须是fasta,名字可以自己随便命名,具体做法下面有说明)。 法2:从NCBI中的ftp库下载所需要的某一个库或几个库,其链接为ftp://ftp.ncbi.nl...
首先,我们需要进入windows的命令行界面(在“应用”里找命令提示符,或者在运行处输入cmd打开)。 在打开的命令提示符界面,输入“blastn”或者“makeblastdb”,如出现以下界面,代表blast安装成功。 Blastn正常界面: makeblastdb正常界面: 如未出现以上界面,或者报错,说明blast安装有问题,请重新回到第一步安装步骤操作。
第一步:Blast安装 Windows版本的Blast安装,参照前贴 《什么?我可以用windows电脑玩Blast?》 Linux服务器版本的Blast安装,可使用 Conda方法或者下载源码 Conda安装方法最简单,一条命令完成: conda install blast (前提是你的linux服务器上安装了conda。关于conda的介绍,请看前贴 《善用Bioconda,管理好自己的Linux工具库...