将真实基因数和广义泊松分布参数以及通过RNAseq样品浓度得到测序覆盖度相关联就可以确定真实基因表达量的后验分布,进而用这个分布作为无重复RNA-seq试验进行差异基因分析的基础。
4.2.2. 小鼠htseq-count-f bam-s noT883-S01-01T0002.bam/home/wanghongli/mm10/mm10.ncbiRefSeq.gtf>T883-S01-01T0002.count人类 htseq-count-f bam-s noT883-S01-01T0002.bam/home/wanghongli/hg38/hg38.ncbiRefSeq.gtf>T883-S01-01T0002.count 5:无重复样本差异分析 5.1count转RPKM RPKM=count...
⽆⽣物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biological replicates BMC Bioinformatics 的⼀篇⽂章中提出了⼀种新的差异基因分析⽅法。这篇⽂章提出了CORNAS(COverage-dependent RNA-Seq) ⽅法，利⽤贝叶斯⽅法来推断真实基因表达数的后验...