方法:本研究采用单细胞rna测序技术(scRNA-seq)分析了从Tg(Brn3c:mGFP)幼虫中分离得到的所有毛细胞均表达GFP的GFP+细胞。通过标记基因的原位杂交分析,我们鉴定了毛细胞的三种亚型,即黄斑毛细胞(MHC),嵴毛细胞(CHC)和神经肥大毛细胞(NHC)。毛细胞scRNA-seq数据揭示了毛细胞特异性基因,包括已在人类中鉴定的听力损失基因和...
作者假设,由于心房和心室中这些细胞类型的功能差别,这种细胞类型的亚结构可能存在空间差异。于是使用Tomo-seq方法(一种用冷冻切片机沿感兴趣的轴对组织进行切片,然后在每个切片上进行RNA-seq的技术)进行空间分辨率转录组,并将空间数据解卷积为单细胞转录谱,可以验证一些细胞亚型在心房和心室富集(图1c)。之后再通过物理...
2023年9月,云序客户苏州大学陈涛团队在Journal of Hazardous Materials(IF=13.6)上发表题为“AHR-mediated m6A RNA methylation contributes to PM2.5-induced cardiac malformations in zebrafish larvae”的研究性论文。在这项研究中,通过m6A Merip-seq、 RNA-seq 等实验证明了 PM2.5 中的可萃取有机物(EOM)会显著...
目的:探讨先天性纯红细胞再生障碍性贫血(DBA)相关 microRNA 的表达特征及其调控机制。方法利用 morpholino 技术建立核糖体蛋白基因 Rps19表达不足的 DBA 斑马鱼模型和Rps19与 p53同时表达不足的斑马鱼模型,利用新一代高通量测序(RNA-seq)技术,研究 DBA 斑马鱼模型的 microRNA 表达谱的特征及 p53...
目的:探讨先天性纯红细胞再生障碍性贫血(DBA)相关 microRNA 的表达特征及其调控机制.方法利用 morpholino 技术建立核糖体蛋白基因 Rps19表达不足的 DBA 斑马鱼模型和Rps19与 p53同时表达不足的斑马鱼模型,利用新一代高通量测序(RNA-seq)技术,研究 DBA 斑马鱼模型的 microRNA 表达谱的特征及 p53在其中的调控作用.结...
单细胞测序网讯:2023年2月22日,来自德国马克斯·普朗克生物智能研究所的HerwigBaier教授团队在Science Advances上发表了题为“A single-cell resolution gene expression atlas of the larval zebrafish brain”的资源型论文,作者使用优化后的HCR技术构建了整个幼体斑马鱼大脑的空间层面的单细胞分辨率基因表达图谱。深入研究了...
在这项研究中,通过m6A Merip-seq、 RNA-seq 等实验证明了 PM2.5 中的可萃取有机物(EOM)会显著降低斑马鱼幼体心脏中全局 m6A RNA 甲基化水平,而甲基供体甜菜碱则可恢复这一水平。甜菜碱还能减轻 EOM 诱导的 ROS 过度生成、线粒体损伤、细胞凋亡和心脏缺陷。此外,作者发现 EOM 激活的芳基碳氢化合物受体(AHR)...
在这项研究中,通过m6A Merip-seq、 RNA-seq 等实验证明了 PM2.5 中的可萃取有机物(EOM)会显著降低斑马鱼幼体心脏中全局 m6A RNA 甲基化水平,而甲基供体甜菜碱则可恢复这一水平。甜菜碱还能减轻 EOM 诱导的 ROS 过度生成、线粒体损伤、细胞凋亡和心脏缺陷。此外,作者发现 EOM 激活的芳基碳氢化合物受体(AHR)...
在这项研究中,通过m6A Merip-seq、 RNA-seq 等实验证明了 PM2.5 中的可萃取有机物(EOM)会显著降低斑马鱼幼体心脏中全局 m6A RNA 甲基化水平,而甲基供体甜菜碱则可恢复这一水平。甜菜碱还能减轻 EOM 诱导的 ROS 过度生成、线粒体损伤、细胞凋亡和心脏缺陷。此外,作者发现 EOM 激活的芳基碳氢化合物受体(AHR)...