第一步读入数据 代码语言:javascript 复制 mydf<-read.csv("Single_Cell/covid_metadata_c.csv",header=T,row.names=1)dim(mydf)mydf 这里作图用到的是ggscatter()函数,这个函数来自ggpubr这个包。 最基本的散点图 代码语言:javascript 复制 library(ggpubr)ggscatter(mydf,x="DPS",y="ISG") 这里需要...
ggplot2基本的散点图并添加拟合曲线 代码语言:javascript 复制 library(ggplot2)p<-ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+geom_smooth(method="lm",se=FALSE,color="black",formula=y~x)+geom_point()p 题外话:有读者在公众号留言说R语言做出来的图有锯齿,应该是在Rstudio那个图形显示界面就是这个,如果导出图片...
在R语言中,绘制散点图并添加拟合曲线是一个常见的任务。以下是一个详细的步骤指南,包括准备数据、绘制散点图以及添加拟合曲线的代码示例。 1. 准备数据 首先,我们需要准备一组用于绘制散点图的数据。这里我们生成一些示例数据: r # 生成示例数据 set.seed(123) # 设置随机种子,以便结果可重复 x <- sort(...
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labs(title = paste0("R = ", cor_value, ", p = ", p_value)) 注:#geom_smooth函数用来向散点图中添加拟合曲线,当然,这里只是用了lm直线拟合方法,同样可以选择一般线性模型glm、一般加性模型gam和曲线loess等。 这个是改成loess拟合的结果。
散点图通常用来刻画两个连续型变量之间的关系。每个点代表一个观测值。 拟合曲线 通常,为了呈现数据的趋势,还会添加一些直线来表现某些统计模型的预测值。这对于ggplot2来说,是容易的。 拟合线 如何添加回归模型拟合线呢? 运行stat_smooth函数并设定method=lm。
在绘制带拟合曲线的散点图时,一般需要经历以下几个步骤: 二、具体操作步骤 1. 导入数据 首先需要将数据导入R中,可以使用以下代码: # 读取数据data<-read.csv("data.csv") 1. 2. 2. 创建散点图 接下来我们创建散点图,使用以下代码: # 绘制散点图plot(data$x,data$y,main="Scatter Plot with Fitted ...
week1 整个新系列。目前的几个系列, #R实战 以生信分析为主, #跟着CNS学作图 以复现顶刊Figure为主,而本系列 #R绘图 则是学习不在文章中但同样很好看的图,致力于给同学们在数据可视化中提供新的思路和方法。开…
图1. 目标图d 借鉴到其他研究中时,可用来做相关性分析。 二、方法与分析包 在本次案例中,绘制散点图,用到的是ggplot2包中的geom_smooth()函数。ggpubr包中的stat_cor()函数。 三、图片复现与R语言方法实践 3.1、安装程序包 rm(list=ls())#clear Global Environment library(ggplot2) library(ggpubr) ...
R语言之可视化①③散点图+拟合曲线 === 散点图一般用于展示两个变量之间的关系(比如线性相关)例如两个基因表达量的相关性。 cor.test(datagene2)Pearson's product-moment correlationdata: data gene1 and data$gene2t = 2.4858, df = 395, p-value = 0.01334 95 percent confidence interval:0.02600102 0.2...