为比较CH和MDS之间的异常剪接转录本,本研究比较了CH和MDS队列中至少一种红细胞分化轨迹细胞的异常3'剪接位点。虽然CH中显著的异常3'剪接位点的总数低于MDS,但共有异常剪接事件存在显著重叠(图6C)。同样,对于MDS,本研究发现了红系成熟过程中特定阶段的异常剪接事件,其中大多数与MDS的异常剪接位点重叠(图6D)。CH和MD...
其中有代表性的是Myc, 它是一个参与正常细胞功能的基因,在许多癌症中均被扩增,并与剪接因子的自调控中的剪接变化有关。 随后,作者将PEGASAS进一步应用到大量的乳腺癌和肺癌样本,并发现这两种癌症中Myc活性与异常剪接之间的关系具有与前列腺癌中类似的模式,这表明由于Myc信号通路的激活从而导致剪接破坏在许多癌症中发生...
顺式元件主要包括：5'和 3’剪接位点、内含子剪接增强子（ISE）、内含子剪接沉默子（ISS）、外显子剪接增强子 (ESE) 、 外显子剪接沉默子 (ESS)。这些元件的突变就可能造成异常剪接，而最常见的是在外显子-内含子接头处位点的突变，如5'和3’ splice site的突变（内含子两端为AG-exon-GT保守序列）。| Mini...
Nature Genetics:人类组织的异常剪接预测 编辑推荐: 到目前为止,还无法解释大约一半罕见遗传性疾病的病因。慕尼黑的一个研究小组开发了一种算法,可以预测基因突变对RNA形成的影响,比以前的模型精确6倍。因此,可以更准确地确定罕见遗传疾病和癌症的遗传原因。
1. mRNA 异常剪接的含义和意义 mRNA 异常剪接指的是在转录后的 mRNA 水平上发生的剪接异常,而不是在 DNA 水平上。这种异常剪接可能导致编码蛋白质的错误,进而影响基因的功能。这种异常在许多疾病中都起着关键作用,包括癌症、遗传性疾病和自身免疫性疾病。研究 mRNA 异常剪接及其验证实验技术对于理解疾病的发生和发展...
在这些类型里,异常的外显子跳跃是造成很多罕见病的一类异常可变剪接。一方面,外显子跳跃是高等生物中最常见的可变剪接类型(参见上一篇),相对而言发生异常的概率比较高;另一方面,外显子跳跃带来的部分氨基酸缺失会对正常蛋白质的结构和功能造成比较大的影响,容易导致疾病发生。
利用GoT剪接技术,研究人员还在无症状的克隆性造血(CH,clonal hematopoiesis,一种血细胞类型的轻度异常增殖)患者的骨髓细胞中发现了MDS样改变,而这种情况往往涉及SF3B1的突变。研究者Landau说到,在CH患者中的发现表明,CH和明显疾病之间的界限或许是量变而并非质变,如果异常细胞的克隆相对较小,那么骨髓的其它部分就能起到...
人类基因组90%以上的基因都可以发生可变剪接,RNA的可变剪接使单个基因产生多个转录本,是蛋白组学多样性的主要原因之一【1】。可变剪接受到多种顺式调控元件和反式作用因子的严格调控,而其错误调控会导致多种人类疾病,尤其是癌症【2, 3】...