1.序列Blast 首先,要有感兴趣的蛋白序列文件,保存为Fasta格式的文本文件,可使用记事本、Notepad++、Sublime等文本编辑器进行编辑保存。 接着,使用NCBI数据库中的BLAST在线工具,就可以得到同源序列。 网址链接: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 注意,由于是蛋白序列,这里选择点击Protein BLAST按钮。 在BLAST工具参数设...
该程序将核酸/蛋白质序列与公开数据库所有序列进行匹配比对,从而找到相似序列。 有在线和单机版两种 需要批量处理、对数据库有特殊要求。涉及序列隐私等情况可以下载使用单机版。 一、BLAST界面 网址:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ 二、Blastp检索 1.基本检索 1.1 enter query sequence(输入查询序列) query subr...
在分子生物学中,往往需要对微生物一段基因序列与数据库中的序列进行比对,看是否发生碱基突变等,或想知道某段基因序列是来自哪个蛋白中或者物种。NCBI为最具权威的在线数据库,通过其中BLAST的比对,可解决以上问题,在此对如何比对做一简单介绍: 工具/原料 电脑 互联网 方法/步骤 首先百度搜索NCBI,点击第一个搜索结果...
1 首先百度搜索NCBI，点击第一个搜索结果 2 进入之后点击如图所示的BLAST 3 进入BLAST界面，选择核酸比对，即单击图中标出的部分 4 在如图所示框中输入要比对的序列 5 微生物的其他部分不用改，直接点击最下面的BLAST，如图所示 6 得到比对结果，如图所示，如果想看其中一个，如第一个，可单击如图红色部分。7 ...
工具/原料 在线网站NCBI 方法/步骤 1 输入网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/，进入ncbi网站 2 点击右方popular resources下方的blast，此为在线blast工具 3 点击nucleotide BLAST 进入如下图界面 4 这五种blast的方式，和下方可以采用的数据库 注意事项 注意自己所要用的物种 注意上传自己的序列 ...
手把手教你：Primer-BLAST进行引物序列比对 一、Primer-BLAST简介Primer-BLAST是一种在线工具，用于设计PCR引物并进行引物特异性分析。它可以帮助科学家们在基因组数据库中查找并比对目标序列，以确保引物的特异性，从而避免因引物二聚体或非特异性扩增等问题导致的实验失败。Primer-BLAST不仅提高了引物的设计效率，而且...
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)可以说是短序列比对中最常用的比对工具了,它不仅支持核酸和蛋白的双序列比对,而且可以在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较,找到与查询序列相似的序列。 NCBI上的在线BLAST具有四种功能模块:Nucleotide BLAST(核酸序...
4.磷酸化位点预测与分析：磷酸化和去磷酸化是细胞内信号传导的重要方式，应用在线服务NetPhos 2.0 ...
接着可以使用NCBI数据库中的BLAST在线工具(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)得到同源序列并下载完整的FASTA序列。 在上一个页面直接点击右边工具栏中的--Run BLAST,直接跳转到BLAST工具页面。 点击BLAST按钮,开始检索同源序列。 跳转到这个页面之后需要等一会才会出现结果页面,在线检索结果需要时间。
BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）可以说是短序列比对中最常用的比对工具了，它不仅支持核酸和蛋白的双序列比对，而且可以在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较，找到与查询序列相似的序列。NCBI上的在线BLAST具有四种功能模块：Nucleotide BLAST(核酸序列比对到核酸库)、Protein BLAST（蛋白序列比对到蛋白...