使用了团队之前开发的Slideseq空间转录组测序技术,对小鼠胚胎发育中器官形成E8.5-E9.5时期的绘制了完整的3D转录组图谱,并且揭示了Tbx6突变带来的独特细胞状态。
作者通过对1.2万余个来自小鼠E9.5胚胎原肠管的单细胞scATAC-seq数据的分析,发现细胞类型特异的染色质开放区域富集在一些已知的器官分化标记基因附近,例如Sox2, Cdx2, Pdx1和 Nkx2-1等。结合基因本体(gene ontology)等分析,作者发现,在原肠...
该研究首次构建了小鼠早期胚胎着床后发育时期高分辨率时空转录组图谱,揭示了小鼠胚胎多能干细胞的分子谱系和多能性在时间和空间上的动态变化及其调控网络,并首次从分子层面揭示了内胚层(Endoderm)谱系在上胚层(Epiblast)产生前新的谱系来源,阐释了Hippo/Yap信号通路在早期胚胎发育期间参与内胚层发育的重要功能。这项工作为...
研究团队利用华大自主研发时空组学技术Stereo-seq，首次绘制了小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱。其中，基于高精度大视场Stereo-seq技术绘制的小鼠胚胎发育时空图谱相关成果在《细胞》（Cell）期刊在线发表，斑马鱼、果蝇、拟南芥时空图谱相关成果在《细胞》子刊《发育细胞》（Developmental Cell）...
科学家创建了基于小鼠的胚胎大脑发育分子图谱 摘要:近日,发表在《Nature》上的一项研究中,来自瑞典卡罗林斯卡医学院领导的研究团队利用单细胞技术开发出一份详细的小鼠胚胎大脑发育分子图谱。 近日,发表在《Nature》上的一项研究中,来自瑞典卡罗林斯卡医学院领导的研究团队利用单细胞技术开发出一份详细的小鼠胚胎大脑发育...
近日,美国华盛顿大学医学院基因组科学系Jay Shendure教授团队利用单细胞转录组测序数据,系统重建了小鼠胚胎发育的第3.5~13.5天中的细胞轨迹图,定义了19个连续阶段的胚胎细胞状态,并捕捉到了部分细胞类型的基因表达变化,绘制出关键的分子变化,由...
图: 早期胚胎发育时期胚胎空间转录组的空间表达结构域及其相似性。 A,小鼠着床后早期(E5.5)到原肠运动晚期(E7.5)不同时期的空间表达结构域; B,早期胚胎空间表达结构域的相似性。 不同时期的颜色条代表基因表达结构域,MOR-桑椹胚,ICM-内细胞团,Epi-上胚层,PrE-原始内胚层,En-内胚层,E1-内胚层基因表达结构域1...
该研究首次构建了小鼠早期胚胎发育不同阶段增强子RNA(eRNA)的表达调控图谱,并鉴定到一个调控合子基因组激活的关键eRNA分子——MZGAe1。该研究为哺乳动物早期胚胎发育过程中eRNA研究提供了宝贵的数据资源,对干细胞和再生医学研究具有重要意义。 为了系统性研究eRNA在哺乳动物早期胚胎发育过程中的表达、调控及功能,余华教授团...
本报讯(记者刁雯蕙)复旦大学附属妇产科医院、深圳华大生命科学研究院等,利用华大自主研发的时空组学技术,成功构建并解析了胚胎植入后第7.5天至第14.5天小鼠胎盘发育的时空图谱,为探索胎盘发育的关键基因和通路提供了宝贵的数据资源和重要线索。相关研究近日发表于《细胞发现》。
接下来,作者通过阻断母源mRNA 翻译,证明了母源 mRNA 翻译的激活在小鼠胚胎着床前发育中母体到合子转变(MZT)过程中的关键作用。 基于LiRibo-seq的翻译图谱揭示了早期胚胎发育中mRNA翻译的动态变化,同时也有助于鉴定母体到合子转变过程中重要的调控因子。作者通过比较卵母细胞到受精卵翻译活性 的转变,鉴定出Smarcd2 和...