使用了团队之前开发的Slideseq空间转录组测序技术,对小鼠胚胎发育中器官形成E8.5-E9.5时期的绘制了完整的3D转录组图谱,并且揭示了Tbx6突变带来的独特细胞状态。
研究团队利用华大自主研发时空组学技术Stereo-seq，首次绘制了小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱。其中，基于高精度大视场Stereo-seq技术绘制的小鼠胚胎发育时空图谱相关成果在《细胞》（Cell）期刊在线发表，斑马鱼、果蝇、拟南芥时空图谱相关成果在《细胞》子刊《发育细胞》（Developmental Cell）...
图: 早期胚胎发育时期胚胎空间转录组的空间表达结构域及其相似性。 A,小鼠着床后早期(E5.5)到原肠运动晚期(E7.5)不同时期的空间表达结构域; B,早期胚胎空间表达结构域的相似性。 不同时期的颜色条代表基因表达结构域,MOR-桑椹胚,ICM-内细胞团,Epi-上胚层,PrE-原始内胚层,En-内胚层,E1-内胚层基因表达结构域1...
该研究首次构建了小鼠早期胚胎着床后发育时期高分辨率时空转录组图谱,揭示了小鼠胚胎多能干细胞的分子谱系和多能性在时间和空间上的动态变化及其调控网络,并首次从分子层面揭示了内胚层(Endoderm)谱系在上胚层(Epiblast)产生前新的谱系来源,阐释了Hippo/Yap信号通路在早期胚胎发育期间参与内胚层发育的重要功能。这项工作为...
为了系统性研究eRNA在哺乳动物早期胚胎发育过程中的表达、调控及功能,余华教授团队首先联合西湖大学王曦研究员通过整合已发表的小鼠早期胚胎表观组以及数据库和文献中提供的增强子注释信息,并利用转录组数据和eRNA分子的双向转录特征,开发了新算法“eRNAFinder”,构建了小鼠早期胚胎发育eRNA的时空图谱。
本报讯(记者刁雯蕙)复旦大学附属妇产科医院、深圳华大生命科学研究院等,利用华大自主研发的时空组学技术,成功构建并解析了胚胎植入后第7.5天至第14.5天小鼠胎盘发育的时空图谱,为探索胎盘发育的关键基因和通路提供了宝贵的数据资源和重要线索。相关研究近日发表于《细胞发现》。
深圳华大生命科学研究院主导,联合国内外多个单位,利用华大自主时空组学技术Stereo-seq,解析了在小鼠胚胎发育过程中的转录组表达的时空动态变化。该小鼠胚胎发育图谱将有助于深入探究哺乳动物发育的机制。该成果于2022年5月4日发表于Cell,以下是文章共同第一作者吴亮博士的详细解读。
研究团队利用华大自主研发时空组学技术Stereo-seq，首次绘制了小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱。其中，基于高精度大视场Stereo-seq技术绘制的小鼠胚胎发育时空图谱相关成果在《细胞》（Cell）期刊在线发表，斑马鱼、果蝇、拟南芥时空图谱相关成果在《细胞》子刊《发育细胞》（Developmental Cell）...
研究团队利用华大自主研发时空组学技术Stereo-seq,首次绘制了小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱。其中,基于高精度大视场Stereo-seq技术绘制的小鼠胚胎发育时空图谱相关成果在《细胞》(Cell)期刊在线发表,斑马鱼、果蝇、拟南芥时空图谱相关成果在《细胞》子刊《发育细胞》(Developmental Cell)在线...
研究团队利用华大自主研发时空组学技术Stereo-seq,首次绘制了小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱。其中,基于高精度大视场Stereo-seq技术绘制的小鼠胚胎发育时空图谱相关成果在《细胞》(Cell)期刊在线发表,斑马鱼、果蝇、拟南芥时空图谱相关成果在《细胞》子刊《发育细胞》(Developmental Cell)在线...