这项大规模研究揭示了数以万计的配体-蛋白相互作用,如今可以利用这些相互作用开发化学工具和药物。此外,在机器学习和人工智能的驱动下,它还能对小分子如何与活的人体细胞中的所有蛋白相互作用进行无偏见的预测。他们生成的所有数据和模型都免费提供给科学界。 大多数药物都是影响蛋白活性的小分子。如果对这些小分子有充...
DeepMind团队开源的AlphaFold 2,西雅图华盛顿大学开源的RoseTTAFold,在没有实验确定结构的情况下提供对蛋白质功能的深入了解,并快速生成蛋白质-蛋白质复合物的准确模型。该方法可以很容易地与现有的小分子和蛋白质结合剂设计方法相结合,以改进针对目标靶标的新蛋白质和小分子配体的计算发现。 2021年7月22日,DeepMind团队...
蛋白质与底物复合物体系的绝对结合自由能计算 酶与底物或抑制剂,受体与药物的结合自由能是重要的热力学量.通过计算机模拟方法计算复合物体系的自由能,特别是绝对结合自由能,对于评价酶与底物的结合能力,预测小分子... 宋伟,陈慰祖,王存新 - 全国生物物理大会学术会议 被引量: 0发表: 0年 凝血因子Xa的S4口袋部分...
AlphaFold 3预测所有生物分子 新一代 AlphaFold——由 Google DeepMind 和 Isomorphic Labs 研究团队推出的革命性AI模型 AlphaFold 3——登上了Nature。AlphaFold3能够对包括蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基在内的复合物进行联合结构预测。对于蛋白质与其他分子类型的相互作用,AlphaFold3 与现有的预测方法相比,至少...
DeepMind团队开源的AlphaFold 2,西雅图华盛顿大学开源的RoseTTAFold,在没有实验确定结构的情况下提供对蛋白质功能的深入了解,并快速生成蛋白质-蛋白质复合物的准确模型。该方法可以很容易地与现有的小分子和蛋白质结合剂设计方法相结合,以改进针对目标靶标的新蛋白质和小分子配体的计算发现。