blast db:ftp.ncbi.nlm.nih.gov/bl README:ftp.ncbi.nlm.nih.gov/bl 但是以NT库为例,截至2022年11月17日包有219G,网络不好的情况下,下载很慢,如何快速下载? 1.Aspera 下载 nt 库: ascp -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 100M -k 1 -T anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:...
假设有一序列数据(sequence.fa,多序列,fasta格式),欲自己做成Blast数据库,典型的命令如下:核酸序列:$ ./formatdb –i sequence.fa –p F –o T/F蛋白序列:$ ./formatdb –i sequence.fa –p T –o T/F执行blast:获得了单机版的Blast程序,解压开以后,如果有了相应的数据库(db),...