这样,我们就成功将基因id “ENSG00000157764” 转换为基因名 “TP53”。 序列图 下面是基因id转换为基因名的流程的序列图示例: org.Hs.eg.dbbiomaRtRUserorg.Hs.eg.dbbiomaRtRUser安装依赖库连接到biomaRt数据库获取注释信息进行基因id转换输出结果 类图 以下是在基因id转换为基因名过程中使用的类的UML类图示例: c...
RNAseq原始数据中基因名称是"ENSG"开头的Ensemble ID,而实际分析时需要将ENSG转换为对应的基因名称。下面以GEO数据库 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE213001) 下载到的GSE213001_Entrez-IDs-Lung-IPF-GRCh38-p12-logRPKMs-normalised.csv为例 (肺纤维化患者与健康人的Bulk tissue RN...
RNAseq原始数据中基因名称是"ENSG"开头的Ensemble ID,而实际分析时需要将ENSG转换为对应的基因名称。下面以GEO数据库 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE213001) 下载到的GSE213001_Entrez-IDs-Lung-IPF-GRCh38-p12-logRPKMs-normalised.csv为例 (肺纤维化患者与健康人的Bulk tissue RN...