那么除了string这个数据库以外,小编最近又发现了一个新的工具GeneMANIA(https://genemania.org/)也可以用来构建基因相互作用网络图,并且对基因功能做相关的分析。使用起来也是相当的方便。 首先我们需要选择相应的物种,目前GeneMANIA支持9个物种 这里我们以人为例 2.输入需要构建相互作用网络的基因名称,点击放大镜就可以进...
基因之间的相互作用是指一个基因与其他基因之间的各种关系,如调节、互作、拮抗等。这些相互作用需要在细胞内的复杂分子网络中发挥作用,产生不同的代谢产物和功能。基因之间的相互作用是维持生命和控制生命过程的重要因素。 基因网络是指基因之间相互作用和相互影响所形成的网络。基因网络是复杂而多样的,并且是动态变化的...
基因间相互作用网络是指基于基因芯片数据,利用计算算法和生物信息学工具,构建表达量和相互作用关系之间的图论模型。这个过程可以通过对基因芯片数据进行聚类、相关性、共表达量等方式来建立相互作用网络。这些网络可以帮助我们更好地理解基因之间的关系,从而分析基因功能的复杂性、发现信号通路的途径、预测基因的表达和组合,...
那么除了string这个数据库以外,小编最近又发现了一个新的工具GeneMANIA(https://genemania.org/)也可以用来构建基因相互作用网络图,并且对基因功能做相关的分析。使用起来也是相当的方便。 首先我们需要选择相应的物种,目前GeneMANIA支持9个物种 这里我们以人为例 2.输入需要构建相互作用网络的基因名称,点击放大镜就可以进...
那么除了string这个数据库以外,小编最近又发现了一个新的工具GeneMANIA(https://genemania.org/)也可以用来构建基因相互作用网络图,并且对基因功能做相关的分析。使用起来也是相当的方便。 首先我们需要选择相应的物种,目前GeneMANIA支持9个物种 这里我们以人为例 ...
在生物信息学领域,研究基因与基因之间的相互作用以及基因的功能至关重要。然而,通过体外和体内实验来揭示这些网络往往需要大量的资源,限制了样本分析的通量。为了解决这个问题,Yuka Takemon和Marco A Marra开发了一个名为GRETTA的R包,使得利用公开数据进行基因相互作用和协同必需网络分析变得更加简单易行。现在,小果将为...
伯豪生物全称上海伯豪生物技术有限公司,在生命科学领域为科研工作者提供技术支持及服务、科研试剂产品的公司。主营业务:单细胞测序、单细胞核测序、单细胞ATAC测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、空间基因测序、空间转录组测序、FFPE空间转录组测序等,多组学科研技术服
互斥是指多基因变异事件之间可能存在功能冗余或拮抗作用,较少存在于同一肿瘤。多基因变异的共现和互斥可以反映基因相互作用,可能塑造不同的生物学表现型并影响乳腺癌治疗效果。近年来,肿瘤多基因变异相互作用受到越来越多的关注,但是其具体...
相互作用网络分析基础 基于ORA和GSEA的分析,主要还是基于基因的功能来进行富集的一种分析方式。网络分析虽然也算是一种富集分析,但是这个分析的思想还是主要观察基因与基因之间的相互作用关系来寻找更重要的基因。我们都知道,一个基因要行使功能,肯定不是独立地行驶功能的,而是通过和其他基因相互作用来发挥作用的。我们...
为了更好地了解孟鲁司特相关神经精神 AE 的毒理学机制,我们从公共数据库中提取了与孟鲁司特相互作用的人类基因数据集,并构建了药物-基因相互作用网络。对这些基因进行了功能富集分析,以阐明孟鲁司特相关的神经精神 AE 的潜在毒理学机制。 方法 数据源