基因交互作用是遗传学中一个重要的概念,它揭示了基因在生物体内相互协调配合的机制,对于研究遗传规律和生物多样性具有重要意义。 基因交互作用可以发生在同一染色体上的不同位点,也可以发生在不同染色体上的基因之间。这种交互作用可以通过染色体重组、基因重组、基因调控等方式进行。基因交互作用的结果常常是基因表达的变化...
当前基因-基因交互作用的研究热点是在全基因组中进行交互作用检测,主要挑战有二个,一是在全基因组数据上的交互作用检测会遇到密集计算的负担,二是对交互作用的检测会受到边际作用的影响.单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP),作为一种遗传标记,由于其广泛存在于基因组中,并且容易测定,常被用作基因关联研究...
多因子降维法分析基因一基因交互作用的应用进展 唐迅李娜陈大方胡永华 【关键词】多因子降维法;病例对照研究;基凶一基因交瓦 作用 Recentadvancesinapplicationsofmultifactordimensionality reductionfordetectinggene—geneinteractionsTANGXun, L,NⅡ,CHENDa一ng,HUYonghua.KeyLaboratoryof ...
几种基因交互作用研究方法的样本量比较
目前已有多个研究称上位性(基因-基因交互作用)在常见的复杂疾病的表型与基因型关系中发挥关键作用ADDINEN.CITE[1-3]。因此,正确的分析基因-基因(环境)的交互作用对于复杂疾病的病因探索或寻找易感基因有着重要意义。 目前用于交互作用分析的方法有很多种,最常用的有叉生分析、Logistic回归、多因子降维法。此外还有...
哈佛医学院Alexander Gusev近日撰文介绍了3种基因环境交互作用(Gene-environment interactions,简称G-by-E或GxE)的主要模型,并特别探讨了社会学概念里的“同型婚配”现象作为一种环境因素对于遗传率的影响。 …
目前已有多个研究称上位性(基因-基因交互作用)在常见的复杂疾病的表型与基因型关系中发挥关键作用[1-3]. 因此,正确地分析基因-基因(环境)的交互作用对于复杂疾病的病因探索或寻找易感基因有着重要意义. 目前用于交互作用分析的方法有很多种,最常用的有叉生分析、Logistic回归、多因子降维法. 此外,还有位点交互作用...
作者采用加权随机森林(weighted random forest),在控制协变量的基础上,对EGLN基因家族进行降维分析,识别出早期肺腺癌预后相关的DNA甲基化位点:cg25923056。进一步研究发现:编码脯氨酸羟化酶EGLN2 基因的cg25923056位点高甲基化能够抑制EGLN2的基因表达,强化HIF1A的基因表达。并且,两个基因存在交互作用。即EGLN2的表达量...
基因-基因(环境)交互作用分析方法的比较