哈佛医学院Alexander Gusev近日撰文介绍了3种基因环境交互作用(Gene-environment interactions,简称G-by-E或GxE)的主要模型,并特别探讨了社会学概念里的“同型婚配”现象作为一种环境因素对于遗传率的影响。 识别遗传变异与环境之间的相互作用(GxE)一直是人类遗传学中的一项挑战。虽然在其他生物体中这种相互作用较易观察...
基因交互作用是遗传学中一个重要的概念,它揭示了基因在生物体内相互协调配合的机制,对于研究遗传规律和生物多样性具有重要意义。 基因交互作用可以发生在同一染色体上的不同位点,也可以发生在不同染色体上的基因之间。这种交互作用可以通过染色体重组、基因重组、基因调控等方式进行。基因交互作用的结果常常是基因表达的变化...
本文使用生物信息学方法,识别出早期肺腺癌预后相关的DNA甲基化位点:cg25923056。进一步研究编码脯氨酸羟化酶EGLN2基因的cg25923056位点高甲基化能够抑制EGLN2的基因表达,强化HIF1A的基因表达。并且,两个基因存在交互作用。并最终得出结论,降低cg25923056 EGLN2甲基化可能是潜在的药物靶标。本文思路清晰,可能为非小细胞肺癌...
基因-基因交互作用单核苷酸多态群智能冲突规避策略Java平台并行化多核处理器生物信息学是生命科学与信息科学交叉形成的一门新兴学科,目的是高效地挖掘生物实验数据中所包含的生物学意义.基因-基因交互作用研究是生物信息学中基因组分析的重要课题,对于研究复杂疾病的病因有着重要的意义.当前基因-基因交互作用的研究热点是...
方差分析(ANalysis of VAriance,ANVOA)是研究基因环境交互作用的常用方法之一。它通过比较不同处理组之间的方差大小来分析基因和环境之间的关系。方差分析可通过单因素方差分析和双因素方差分析进行。 单因素方差分析是研究基因或环境对表现型影响的一种方法。例如,我们想研究不同基因型对某一性状的影响,就可以将不同基...
作者采用加权随机森林(weighted random forest),在控制协变量的基础上,对EGLN基因家族进行降维分析,识别出早期肺腺癌预后相关的DNA甲基化位点:cg25923056。进一步研究发现:编码脯氨酸羟化酶EGLN2 基因的cg25923056位点高甲基化能够抑制EGLN2的基因表达,强化HIF1A的基因表达。并且,两个基因存在交互作用。即EGLN2的表达量...
目前已有多个研究称上位性(基因-基因交互作用)在常见的复杂疾病的表型与基因型关系中发挥关键作用ADDINEN.CITE[1-3]。因此,正确的分析基因-基因(环境)的交互作用对于复杂疾病的病因探索或寻找易感基因有着重要意义。目前用于交互作用分析的方法有很多种,最常用的有叉生分析、Logistic回归、多因子降维法。此外还有位点...
科学家已经发现由于两种基因的交互作用,这些轴突能够在大脑中识别出他们的目标区域。 科学杂志《自然--神经科学》上公布了德国科学家的研究成果,研究揭示了基因的交互作用影响了神经细胞的生长与连接,从而影响大脑的发育。 人类大脑中约有1000亿个神经细胞。大脑要发育成一个功能完整的有机体,这些神经细胞中的每一个都...
基因环境交互作用在个体发展、疾病易感性、行为表现等方面都具有重要的影响。它可以改变基因的表达方式,进而改变个体的生理功能和性状。例如,人类基因中有些人携带抗体,可以帮助其抵抗特定疾病,但只有在遭遇细菌、病毒等外界致病因子的时候才会发挥作用。而相同基因的人在不同环境下,抗体的表达和功能可能会有所差异。 此...