积分正态分布分析是一种统计方法,用于评估基因集在基因表达数据中的富集情况。这种方法通过将基因的表达值转化为积分正态分布的得分,并计算已知基因集的得分分布。如果已知基因集的得分分布在基因表达数据中显著偏离随机分布,那么可以认为这个基因集在特定条件下受到了富集或贫化。 积分正态分布分析在代谢组学研究中常常...
在基因集分析中,KS检验通常用于比较已知基因集的基因在基因表达数据中的分布与预期分布之间的差异。如果已知基因集的基因在基因表达数据中的分布显著不同于预期分布,那么可以认为这个基因集在特定条件下受到了调控。 KS检验在基因集分析中的应用示例包括研究药物的影响。研究人员可以使用KS检验来确定药物处理后的基因表达...
MAGE项目不仅扩展了我们对人类基因表达多样性的理解,还为研究人类基因组的进化和功能提供了一个包容性资源。通过结合现有的全基因组测序数据,MAGE将成为未来研究人类基因表达和剪接多样性的宝贵资源,推动个性化医疗和进化生物学的研究进展。 总的来...
GEO | 17GEO测序数据差异分析 | 芯片测序 | 高通量测序 | 转录组差异分析 437 -- 7:22 App 孟德尔随机化分析对暴露数据SNP进行F检验并去除弱工具变量 283 -- 6:39 App 所有类型细胞中基因在不同分组的差异表达分析 2377 1 18:38 App 芬兰数据库的数据查找下载和读取并进行孟德尔随机化分析教程 422 --...
1、基于基因表达记忆的scRNA-seq数据集细胞谱系预测 Gene-expression memory-based prediction of cell lineages from scRNA-seq datasets Nat Commun; IF: 16.600; DOI: 10.1038/s41467-024-47158-y 内容概要: ① 通过谱系追踪将单细胞转录组分配给细胞谱系树,已经改变了我们对发育、再生和疾病分化的理解。然而,谱...
网络药理学所需的基因表达谱数据集来自各大数据库。对于骨科研究而言,GEO是最常用的数据库之一。我们可以使用NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)检索GEO数据库。只要选择GEO DataSets字段,就可以在GEO中检索各种基因表达谱数据集。 使用NCBI检索GEO数据库 ...
基因表达数据集中批次效应去除教程 - 邢博士谈科教于20240413发布在抖音,已经收获了2490个喜欢,来抖音,记录美好生活!
STimage-1K4M数据集,由北卡罗来纳大学构建,旨在通过提供子图像瓦片的基因表达信息,填补现有医学图像文本数据集中的描述不足。该数据集包含了1,149张图像,这些图像是从空间转录组数据中提取的,能够捕捉到病理图像中每个独立空间点的基因表达信息。每张图像都被细分为更小的子图像瓦片,每个瓦片都配有15,000到30,000...
可以查看该图的数据,并进行编辑,比如改变某一细胞系的图形类型等,功能相当丰富,大家可以自行了解。 2.Scatter Plots 该模块将基因的表达数据与自身的不同数据集或另一个基因的数据集进行比较。下图为YTHDF1的不同数据集比较结果。 如果要比较该基因与另一个基因的分布,先选择“different gene”标签。输入目的基因,...
模拟基因表达数据集:一个基因组学数据集(REGED:Agenomicsdataset)数据摘要:Thisisoneofthedatasetsofthefirstcausalitychallenge:causationandprediction.Thegoalofthechallengewastomakepredictionsundermanipulations.REGED(REsimulatedGeneExpressionDataset)monitorstheexpressionofgenes,whichcouldberesponsibleoflungcancer.Thedataare...