用于访问基因表达综合数据库(GEO)的Python库。 GEOparse是python软件包,可用于从Gene Expression Omnibus数据库(GEO)查询和检索数据。 它的灵感和基础是伟大的R库GEOquery。 免费软件:BSD许可证 文档: : 。 特征 将GEO系列,数据集等下载为SOFT文件 下载GEO系列的补充文件以在本地使用 将GEO SOFT加载为易于使用和操...
ShinyGEO是一个基于Web的工具,它使用户可以从数据集中下载表达和样品数据,选择感兴趣的基因,并使用可用数据进行存活或差异表达分析。 对于这两种分析,shinyGEO都会生成可用于出版物的图形并生成R代码,以确保所有分析都是可重复的。 该工具是使用Shiny(R的Web应用程序框架)开发的,R是一种用于统计计算和图形的语言。 官...
随着全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多。然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研究组、研究...