没有底线的检测芯片检测的动态范围比较窄,在转录本丰度很低的情况下,RNA-seq 才是你正确的选择。Tong 及其同事去年用 Illumina RNA-seq 平台和 Affymetrix 芯片,评估了大鼠肝脏在药物处理下的基因表达改变。他们发现,在检测丰度较高的基因时,RNA-seq 和芯片的结果基本一致。但在检测表达水平低的基因时,RNA-se...
RNA-Seq:具有非常宽的动态范围,其动态范围可跨越多个数量级,比大多数芯片技术高出几个数量级。这使得RNA-Seq能够检测到更多低丰度的基因,具有更高的灵敏度。 基因芯片:动态范围相对较窄,可能无法准确检测到低丰度的基因。 三、检测能力与准确性 RNA-Seq:不仅能够检测基因表达谱,还能鉴定选择性剪接异构体、剪接位点...
除了基因表达谱分析,RNA-Seq还能鉴定选择性剪接异构体、剪接位点和等位基因特异的表达–所有这些都在单个实验中完成1,2。此外,RNA-Seq还能测序极短的片段,且文库制备方法可包含或排除mRNA提取,这样它就能检测并测序小RNA及多种形式的非编码RNA,如小干扰RNA(siRNA)、microRNA(miRNA)、核仁小RNA(snoRNA)及转运RNA(tR...
RNA-seq现在已经很便宜了,比基因芯片还便宜很多。 测序中收费标准之一来源于数据量(即测序深度),刚刚说了,市场上最流行的的RNA-seq服务数据量是6G/样本,即40M reads或者20M paired reads ,这时候确实比很多芯片都便宜了。但是如果希望更准确检测中、低丰度RNA,就需要更深度的测序保证数据可靠性,这就会导致测序成...
基因芯片和RNA-seq联合组织芯片分析CLDN8在 乳头状肾细胞癌的表达及意义 罡2,李生华2h 张观兰,李建棣2a,杨艺洲,许静婕,陈思智1,杨小萱1,陈 为联合基因芯片或RNA测序技术及免疫组织化学染色探究CLDN8在乳头状肾细胞癌(PRCC)中的表达及 摘要:目的 其临床意义。方法通过GeneExpressionOmnibus数据库、SequenceReadArchi...
DNA芯片关键是“筛”!RNA测序关键是“测”!尽管RNA-seq可作为继往开来的领路人,它相对DNA芯片更加灵敏,可减少漏网之鱼,然而,姜仍是老的辣。只有2种技术强强联手,才会效果翻倍!。 日本推理小说家东野圭吾的作品《白金数据》中描述了这样一个未来世界:日本政府秘密...
n 1,3 由于样品噪音的存在,通过RNA-Seq检测可变剪切事件面临挑战,300MReads测序深度只能提供80%的可信度。 13 n 由于文库制备引入了明显的偏向,在解释外显子水平的RNA-Seq结果时——特别是在寻找可变剪切事件时——应该谨慎。 全转录组分析方案超越基因水平信息 精确的结果 一次实验,多层生物学信息 RNA-Seq...
RNA-seq是比基因芯片更先进的技术,其优势这里不多说了。既然它更先进,那么肯定是首选的技术。目前普遍...
目的:本研究旨在利用单细胞RNA测序(single cell RNA-sequencing,sc RNA-seq)和基因芯片技术筛选出颈动脉不稳定斑块相关细胞的关键基因,进一步构建不同细胞类型的转录因子(transcription factor,TF)-微小RNA(micro RNA,mi RNA)-枢纽基因调控网络,并发掘枢纽基因相关的潜在药物.方法:从基因表达综合数据库(gene expression...
百度试题 结果1 题目以下哪个选项不属于转录组学研究的技术手段? A. 表达序列标签测序(EST) B. 转录组测序分析(RNA-seq) C. 基因编辑技术 D. 基因芯片技术 相关知识点: 试题来源: 解析 C 反馈 收藏