基因组三维预测结构数据细胞核 基因组空问结构的数据处理、结构预测和功能分析 摘要 随着测序技术的快速发展,人们开始大量使用3C及其衍生实验技术来高通量地 获取多个物种的全基因组交互信息,以揭示基因组功能与其空间结构间的关系。然 而实验技术存在一定的局限性,使得这些技术对生物机理的揭示能力极大地依赖于 数据的分...
Cell:通过基因组测序预测膜蛋白的三维结构 导读 膜蛋白的存在使细胞与胞外环境或细胞与细胞之间的“交流”得以实现。超过25%的人类蛋白拥有完整的膜结构域,这些蛋白中许多在医学上非常重要,因为几乎一半的药物靶点都包含一个膜结构域。通过膜蛋白的三维结构可以描述它的分子机制和加速以它为靶点的药物分子的研发。
当前大量的工作已经证明了宏基因组序列可以补充蛋白质的同源序列从而准确构建其三维(3D)结构。然而,尽管大量宏基因组数据被用于辅助蛋白结构预测,但仍有相当数量的蛋白质3D结构无法被准确建模。这种现象引出了一个疑问:对于利用微生物组序列辅助预测蛋白结构这一问题,是否存在依赖于宏基因组数据分布的模式;呼应这种分布模...
当前大量的工作已经证明了宏基因组序列可以补充蛋白质的同源序列从而准确构建其三维(3D)结构。然而,尽管大量宏基因组数据被用于辅助蛋白结构预测,但仍有相当数量的蛋白质3D结构无法被准确建模。这种现象引出了一个疑问:对于利用微生物组序列辅助预测蛋白结构这一问题,是否存在依赖于宏基因组数据分布的模式;呼应这种分布模...
Review:用于蛋白质结构预测的宏基因组定量分析 https://doi.org/10.1002/imt2.9 2022/3/6 ● 2022年3月6日,华中科大宁康组在iMeta在线发表题为“How much metagenome data is needed for protein structure prediction: The advantages of targeted approach from the ecological and evolutionary perspectives”的综...
Review:用于蛋白质结构预测的宏基因组定量分析 https://doi.org/10.1002/imt2.9 2022/3/6 ●2022年3月6日,华中科大宁康组在iMeta在线发表题为“How much metagenome data is needed for protein structure prediction: The advantages of targeted approach from the ecological and evolutionary perspectives”的综述...