目的基因(代谢物)文件准备好后,点选择文件按钮,上传数据,是否包含Log2FC列这里选“不包含”;接着勾选“其他物种”,点选择文件按钮,上传背景代谢物数据;背景基因表类型选择“kopath”,物种类型选植物,最后点提交按钮。由于对代谢组数据的支持目前仅是KEGG富集分析系列工具的“隐藏功能”,工具的界面参数名称暂与常规的...
数据准备: 准备“目的代谢物”的ID列表，合并正负离子模式的差异代谢物，确保数据格式符合KEGG富集分析工具要求。背景代谢物文件准备时，使用注释总表中包含代谢物ID、C_id和Pathway信息的部分，注意处理C_id，确保它作为字符串而非数值。参考设置: 在KEGG富集分析工具中，上传目的代谢物数据文件，选择是否...
基因和代谢物通路机制图该怎么画?🧑🏻💻当我们做完差异代谢物和差异基因KEGG富集分析的时候,该如何研究两组学共同参与的通路机制呢?这就是我们今天要讲的通路机制图可视化,联合logFC值的变化+基因/代谢的调控关系,可以更好的探究组学 - 科研小怪兽儿于202405
目的基因(代谢物)文件准备好后,点选择文件按钮,上传数据,是否包含Log2FC列这里选“不包含”;接着勾选“其他物种”,点选择文件按钮,上传背景代谢物数据;背景基因表类型选择“kopath”,物种类型选植物,最后点提交按钮。由于对代谢组数据的支持目前仅是KEGG富集分析系列工具的“隐藏功能”,工具的界面参数名称暂与常规的...