反义寡核苷酸脱靶?如何预测下游靶基因? 反义寡核苷酸(ASO)是一种短链的合成寡核苷酸,长度通常在16到53个核苷酸之间。它的主要作用是通过与RNA(包括miRNA)高度互补,来阻断RNA的功能。ASO的结构通常包含化学修饰的核苷酸或在两端添加特定序列,以提高其与靶序列的结合亲和力,并使其能够抵抗细胞内核酸酶的降解。 ASO的主...
第二个步骤是计算转录因子的活性。对每一个找到的差异表达的转录因子，NetAct把其调控的靶向基因成员分成...
我现在做实验遇到了点生物信息上的问题，恳请大家帮忙。具体是我现在在做一个基因是转录因子，想做下游...
有意义，虽然不像那些直接用数量调控的基因那么明显。虽然这个基因的直接活性调控是靠磷酸化，但如果蛋白总量明显改变，也会有影响。就像做信号通路，总要有一个蛋白总量不变的WB图。如果总量少了，即使活化的百分比不变，总的活性也是降低了。其实绝大多数蛋白都会有数量调控，应该是一种相对长期的调控机...
本发明的方法基于植物转录因子的DAP‑seq测序数据,在全基因组中检测调控的启动子的Motif元件和位置,并以此为基础,预测转录因子下游调控的靶基因。本发明联合测序数据和生物信息学工具,大大增加了预测的精确度和通量,进而可在大数据量的基础上快速预测出靶基因,提高预测效率。并且本发明的方法普遍适用于植物学领域。
属于生物信息技术领域.本发明的方法基于植物转录因子的DAPseq测序数据,在全基因组中检测调控的启动子的Motif元件和位置,并以此为基础,预测转录因子下游调控的靶基因.本发明联合测序数据和生物信息学工具,大大增加了预测的精确度和通量,进而可在大数据量的基础上快速预测出靶基因,提高预测效率.并且本发明的方法普遍适用于...
版主有得到应助了吗？最近也需要分析这个转录因子和下游基因的结合，无从下手。
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选择在体外核小体是特别丰富,具有较高的预测核小体占用的间隔区相比,与随机基因组的位置,并立即上游或下游选定的核小体的位置 翻译结果2复制译文编辑译文朗读译文返回顶部 翻译结果3复制译文编辑译文朗读译文返回顶部 远缘的比较基因组的任意位置,位置立即上游或下游的选定核小体的高预测核小体入住的地区,特别被丰富...
其实我们知道很多转录因子的结合序列是相对保守的这样我们就可以根据保守的序列进行预测但是由于一般序列比较短所以会预测到很多靶基因这时我们一般通过chipqpcr来反过来进行验证 如何根据转录因子预测靶基因? 我们以前写过如何寻找基因的启动子和预测转录因子:(工具篇):如何查找基因的启动子及预测转录因子?,今天我们反过来做...