如何预测下游靶基因? 反义寡核苷酸(ASO)是一种短链的合成寡核苷酸,长度通常在16到53个核苷酸之间。它的主要作用是通过与RNA(包括miRNA)高度互补,来阻断RNA的功能。ASO的结构通常包含化学修饰的核苷酸或在两端添加特定序列,以提高其与靶序列的结合亲和力,并使其能够抵抗细胞内核酸酶的降解。 ASO的主要作用是干扰DNA转...
红细胞系靶基因生物信息学目的利用生物信息学方法预测miR-210的红细胞系(以下简称红系)相关下游靶基因.方法利用NCBI比对分析miR-210成熟序列在各哺乳动物之间的保守性.运用基因数据库筛选miR-210的下游靶基因.采用Cytoscape中的BINGO插件对预测的miR-210下游靶基因进行GO分类富集分析.筛选参与红系增殖,分化,凋亡的miR-...
miR-210的红细胞系相关下游靶基因预测doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2017.03.006施继禹刘芳丁谨曹艳李文俊Shandong Medical Journal
一种在全基因组水平上预测植物生长发育转录因子调控的下游靶基因的方法,包括 以下步骤: 1)将携带目标转录因子的植物材料作为处理样品,将不携带目标样品的植物材料作为 对照样品;分别提取所述处理样品和对照样品的植物基因组DNA,打断所述植物基因组DNA, 得到DNA片段,以所述DNA片段分别建立处理样品和对照样品的DNA文库;...
有意义，虽然不像那些直接用数量调控的基因那么明显。虽然这个基因的直接活性调控是靠磷酸化，但如果蛋白总量明显改变，也会有影响。就像做信号通路，总要有一个蛋白总量不变的WB图。如果总量少了，即使活化的百分比不变，总的活性也是降低了。其实绝大多数蛋白都会有数量调控，应该是一种相对长期的调控...
导致另外一个基因B的表达量改变，现在我用软件分析预测一下，这个转录因子A的靶基因是否是B，要用什么...
转录因子靶基因预测在线工具:多数据集取交集 Jingle进哥 1.9万3 22:12 转录因子找靶标-ChIPseq结合过表达敲低RNAseq-上-分析思路 纪伟讲测序 14:57 基因测序_上下游分析介绍_学习分享 一直向前青年 04:54 六十五:基因上下游调控关系推断 学术渣在欧洲 ...
其实我们知道很多转录因子的结合序列是相对保守的这样我们就可以根据保守的序列进行预测但是由于一般序列比较短所以会预测到很多靶基因这时我们一般通过chipqpcr来反过来进行验证 如何根据转录因子预测靶基因? 我们以前写过如何寻找基因的启动子和预测转录因子:(工具篇):如何查找基因的启动子及预测转录因子?,今天我们反过来做...
本发明的方法基于植物转录因子的DAP‑seq测序数据,在全基因组中检测调控的启动子的Motif元件和位置,并以此为基础,预测转录因子下游调控的靶基因。本发明联合测序数据和生物信息学工具,大大增加了预测的精确度和通量,进而可在大数据量的基础上快速预测出靶基因,提高预测效率。并且本发明的方法普遍适用于植物学领域。
本发明提供了一种HOXB13联合其下游靶基因检测预测肺腺癌进展,预后及耐药的试剂盒,所述试剂盒中包含HOXB13,ABCG1,EZH2和IL6的qPCR引物,利用本发明所述试剂盒,可有效检测HOXB13及其下游靶基因ABCG1,EZH2和IL6的转录表达水平,通过取4分子表达之和预测肺腺癌患者化疗耐药和疾病预后.并且,该分子组合预示化疗耐药和...