1.一种基于二代和三代测序技术的植物线粒体基因组组装方法,其步骤包括: (1)对样品dna进行二代测序,得到cleanreads; (2)对样品dna进行三代测序,得到cleanreads; (3)利用二代测序数据进行三代数据的校正; (4)利用构建好的植物线粒体编码基因数据库,使用此植物线粒体编码基因数据库中所有参考序列比对第(3)步...
(6)检查步骤:将校正后的三代测序数据使用minimap2比对到pseudogenome序列上,然后筛选比对上的长度大于3kb的测序数据,然后使用mumer查看比对上的三代测序数据和pseudogenome的共线性情况,判断所有比对上的三代测序数据是否均出现在pseudogenome路径上,如果是,则线粒体基因组组装完整;如果在同一位置存在三代测序数据某些序...