变构位点变构位点底物产物B浓度高时物A酶2产物B产物B浓度低时酶1无括性酶1有活性如图为某单细胞微生物细胞代谢中酶与其底物、产物的关系示意图(图中的变构位点指引起酶结构改变的触发点),下列有关叙述正确的是( ) A.从该图可以看出酶促反应速率随底物浓度增大而不断增大B. 酶1有两种底物且能与产物B结合,...
尽管变构位点很关键,但它们却非常难找。此次,研究人员开发了一种名为双深度PCA(ddPCA)的技术来应对这一挑战。他们将其描述为一种“蛮力实验”,就好比发现一辆车有问题之后,不只是检查局部,而是拆卸整辆车,并逐个检查零件。通过一次性测试一万件零件,研究人员确定了所有真正重要的部件。CRG系统生物学项目协调人...
然而,蛋白质的结构并非一成不变,它可以受到位于其表面的“二级锁”(即变构位点)的影响。当一个分子与变构位点结合时,它会引起蛋白质形状的改变,从而改变蛋白质的活性或与其他分子结合的能力,例如通过改变其主锁(活性位点)的内部结...
蛋白质也可以受到位于其表面其他地方的二级锁(变构位点)的影响。当一个分子与变构位点结合时,它会引起蛋白质形状的改变,从而改变蛋白质的活性或与其他分子结合的能力,例如,通过改变其主锁的内部结构。 变构位点通常是药物开发的首选,因为它们提供了更大的特异性,减少了副作用的可能性。它们还可以更微妙地改变蛋白...
这一调控系统的中心是蛋白上称为调控热点的一系列变构位点(Allosteric sites)。这些变构位点通常远离蛋白的活性位点,它们不但对蛋白功能非常重要,而且具备独特的结构特征。因此,靶向调控热点的小分子药物会具备更高的选择性、安全性和效力,甚至也有可能攻克一些难成药靶点(tough-to-drugtargets)。
变构是蛋白质功能中一大未解之谜。当分子与蛋白质表面结合时会产生变构效应,这反过来又会导致该蛋白质远处的位置发生变化,从而通过“遥控”来调节其功能。许多致病突变,包括许多癌症驱动因素,都是因为其变构效应而具有病理性。 尽管变构位点很关键,但它们却非常难找。此次,研究人员开发了一种名为双深度PCA(ddPCA)的...
图1. 变构位点及变构调节剂识别框架RHML是作者整合了无监督聚类和深度学习方法而开发的一个残基可解释性的机器学习模型,能够解决未知MD空间的构象态标签问题和变构位点打开的构象态识别难题,其中所开发的可解释性卷积神经网络CNN的构象态多分类器(图2)使用像素图的构象表征来减少信息损失,并引入局部线性近似的策略开...
通过靶向远离蛋白质相互作用界面的变构位点,变构调节剂可以通过调控作用来改变蛋白质相互作用界面构象,实现阻断或加强蛋白质间相互作用的目的。 因此,变构调节剂被认为是一种全新的、靶向传统“难成药”的蛋白质相互作用界面的药物开发策略。 + 二、蛋白质相互作...
因此,变构位点通常是药物开发的首选,与靶向活性位点的药物相比,靶向变构位点的药物通常更安全、更有效,因为它们提供了更强的特异性,并减少了药物副作用的可能性。此外,靶向变构位点还可以更灵敏地改变蛋白质的活性,为微调其功能提供了可能。 然而,变构位点是非常难以捉摸的。以KRAS为例,经过40多年的研究,研究人员...
这一调控系统的中心是蛋白上称为调控热点的一系列变构位点(Allosteric sites)。这些变构位点通常远离蛋白的活性位点,它们不但对蛋白功能非常重要,而且具备独特的结构特征。因此,靶向调控热点的小分子药物会具备更高的选择性、安全性和效力,甚至也有可能攻克一些难成药靶点(tough-to-drug targets)。