其中细菌是一类只存在拟核的裸露DNA的单细胞原核生物(基因组大小一般小于10Mb),它包括真细菌和古生菌两大类群,根据其基本形态可分为球菌,杆菌,螺旋菌,根据细胞壁组成成分,又分为革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌,大多数化脓性细菌属于革兰氏阳性菌,它们能产生外毒素使人致病;而大多数肠道菌则属于革兰氏阴性菌,它们能产...
莓实假单胞菌NMC25基因组完成图信息公布在GenBank中,登录号为NZ_CP021132.1。 NMC25基因组组装为4 个Scaffold,包含1 个染色体和3 个质粒,测得的总基因组大小为5.152 13 Mb,GC含量为59.21%。菌株基因组中包含4 725 个基因(染色体4 571 个,质粒154 个),编码区基因4 494 个(染色体4 366 个,质粒128 个)...
为了更好地了解铜绿假单胞菌的基因组及耐药机制,科学家们进行了深入的研究。在基因组分析方面,科学家们采用了高通量测序技术,通过测序铜绿假单胞菌的基因组,获得了该菌株的完整基因组序列。同时,通过进行基因组比对和功能注释,科学家们发现了一些与耐药性相关的基因。 首先,科学家们发现了一些铜绿假单胞菌耐药性的...
1、 金鱼源维氏气单胞菌jy01全基因组测序及生物信息分析 吴尉凤 饶秋华 柯文辉 刘洋 卓艺蓉 郑欣欣 罗土炎摘 要:維氏气单胞菌( aeromonasveronii jy01)是从福州某养殖场内金鱼烂尾、腐皮和溃疡等病灶处分离出的1株革兰氏阴性优势菌。为了解其基因组结构及功能特征,基于illuminape150和pacbio测序平台对维氏气单肥...
通过操作实战结合研究实例力求将细菌铜绿假单胞菌流行性分析、耐药性研究落到实处。 课程主要内容: (1) 铜绿假单胞菌的基本特征、临床病症及急性与慢性感染的表型和基因型变化专题讲解; (2)铜绿假单胞菌的基因组特征、质粒特征和群体遗传谱系特征专题讲解; (3)常用分型方法介绍及铜绿假单胞菌的MLST分型、cgMLST...
运动发酵单胞菌基因组测序及比较基因组分析 报告人：曹庆华指导教师：张义正 教授 概要 背景和目的 基因组测序比较基因组学 总结和展望 研究背景 菌株原料微生物发酵燃料乙醇 运动发酵单胞菌（Z.mobilis）作为生产生物质乙醇的重要潜力菌种的优点和缺点 基因组改造乙醇产量高底物范围宽基因组测序 已测序的Z.mobilis基因...
通过研究关键的毒力因子、抗菌素耐药性特征和基因组性状,我们旨在阐明每个物种对条纹鲶鱼种中运动性气单胞菌败血症的发生和严重程度的独特贡献。通过这种比较分析,我们对这些新出现的病原体的流行病学提供了宝贵的见解,最终有助于越南的可持续水产养殖实践和条纹鲶鱼生产的健康。
目的为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性。 方法对虾源分离株进行分子鉴定和多位点序列分型:利用B-溶血和胞外蛋白酶实验、秀丽隐杆线液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及毒力基因检测研究其致病性:通过药罐实验及耐药基因检测分析其耐药特征:利用eggnog、Prop...
多重耐药(MDR)或泛耐药(XDR)铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa, P.ae)在医院内引起的感染率和死亡率显著增加,这得益于P.ae具有染色体基因突变产生耐药性以及水平获得耐药性的非凡能力,这样的因素往往与流行的高危克隆有关。全基因组测序(WGS)已被证明可以用于分析P.ae的耐药性机制,包括突变抗性和水平获...
1、鉴定了一种新的假单胞菌(P. oryziphila)1257菌株,它具有抑制Xoo和Xoc的能力,特别是抑制Xoc在水稻组织中的生长和迁移,从而预防BLS病; 2、基因组信息显示,该菌可能具有杀死昆虫、溶解磷酸盐、依赖T4P系统移动、降解IAA和PAA等功能基因,是一种万能菌; ...