PureCell单细胞平台 完整的免疫组信息 配对且获得全长的TCR/BCR 双链序列信息 免疫图谱定位 在单细胞分辨率下将免疫谱与抗原特异性结合起来 无偏好高灵敏 具有抗原特异性和表型鉴定的单对引物mRNA高灵敏度检测 多种样品兼容 PBMC(新鲜或冷冻)以及活检获得的组织样本 高效的PureCell细胞分选平台 浙江...
首先,通过单细胞转录组测序数据分析,我们可以识别和鉴定出不同的细胞亚群;从TCR/BCR测序数据中,我们可以鉴定出不同的克隆型信息。 2)免疫细胞亚型鉴定 接着,我们可以对免疫细胞进行再分群分析,鉴定不同的免疫细胞亚型,然后根据确定亚型的T/B细胞数据与TCR/BCR数据进行合并分析,获取每一个T/B细胞的克隆型多样性和...
免疫细胞针对纷繁复杂的入侵的病原体(抗原)的免疫反应,依赖于其高度多样性的抗原识别受体B细胞表面受体(B cell receptor ,BCR)和T细胞表面受体(TCR)。BCR由四条肽链构成,由两条相同的重链和两条相同的轻链连接而成(重链和轻链分别由不同基因编码),其中重链分为可变区(Variable regions, V区)、恒定区(Constant ...
免疫组库(Immune Repertoire,IR)是指机体内 T 淋巴细胞和 B 淋巴细胞多样性的总和,反映机体免疫系统在特定时间段内应对外界刺激应答的能力。基于 10X Genomics 的单细胞系统,可实现高通量的单细胞转录组和 V(D)J 测序。不但可以将 TCR/BCR 双链匹配,而且能够同时获得基因表达信息。 10X Genomic 单细胞免疫组库...
关于TCR(BCR)分析其实有两个角度,一个是基因序列角度,一个是氨基酸序列角度,个人倾向于氨基酸序列角度,每个氨基酸的理化性质是固定的,更能从功能角度认识TCR与MHC的结合特性,做单细胞的同学不妨试一试。 先来学习一下基础知识 MHC(我们需要知道MHC的主要功能)...
单细胞TCR/BCR测序(单细胞免疫组库测序),免疫组库是指机体内 T 淋巴细胞和 B 淋巴细胞多样性的总和,反映机体免疫系统在特定时间段内应对外界刺激应答的能力。基于10X的单细胞系统,可实现高通量的单细胞转录组和VDJ测序。,斑马鱼(北京)科技有限公司
第一点,TCR(BCR的聚类方式)Clustering by V-gene, J-gene and junction length 也就是说,聚类的选择有三种,V,J,还有一起用来聚类,(为什么不能单独D也聚类呢?这个大家可以思考一下)。 模式呢,有四种 第一种,Amino acid model,这种模式就是之前分享TCRdist采用的模式,但是不是简简单单的看看是不是相同的氨基...
Takara单细胞TCR-Seq产品引入了更多的对照,在处理复杂样品时可以帮助获得更高质量的数据。辅以友好的数据分析软件,让新手也可以从容应对! 此外,我们还推出了基于孔板的TCR&BCR测序建库方法: 新的TCR和BCR测序分析试剂盒了解下!- Takara (takarabiomed.com.cn) ...
10x单细胞免疫组库是一种在单个细胞水平,同时对转录组基因表达和适应性免疫受体库进行高通量测序的新技术,为免疫调控研究提供了更具扩展性的平台,可以同时获取5’基因表达的数据和 TCR/BCR 的VDJ 全长序列。是一种高效的可同时检测表达和免疫组库的技术,在肿瘤微环境、感染性疾病、免疫治疗等研究领域中有着极为广...
单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近万个细胞,可在一个样本中同时获5'端mRNA表达谱、TCR和BCR的信息,结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的影响免疫应答分析,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生和发展的分子机制。 (图片来源:Wang Y,et al.,Journal of Infection,2023) ...