单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种在单细胞水平对转录组进行测序分析的高通量测序技术,能够揭示细胞层面的基因表达差异,为研究细胞的异质性提供了有力手段。而TCR/BCR测序是一种用于分析T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)的高通量测序技术,可以揭示T细胞和B细胞受体的多样性和特...
对于T细胞的发育过程来说,针对细胞群体测序,只能提供单个TCR链的频率信息,却不能与细胞进行一一配对,而通过单细胞测序的方式能够进行更为细致的研究。同时,在对特定免疫反应的研究中,通过单细胞TCR测序分析,可以减少群体细胞间异质性信息的干扰。 我们知道一种TCR受体往往在一种类型的免疫反应中发挥作用。因此,对单个T...
研究人员使用10xGenomics的单细胞分辨率的T细胞转录组分析和TCR-seq分析来表征接受单克隆抗体药物治疗之前和之后的T-LGLL患者中的T细胞克隆扩增和基因表达的特征。研究人员从13例接受单克隆抗体药物治疗前和后的患者样本中,进行单细胞TCR和CD3+ T细胞的RNA测序。结果证实了 T 细胞的克隆扩增, T-LGLL 中缺乏常见的 TCR...
不但可以将 TCR/BCR 双链匹配,而且能够同时获得基因表达信息。 10X Genomic 单细胞免疫组库测序与单细胞 RNA 测序一样,通过微流控系统将带有条形码和引物的凝胶珠与单个细胞包裹在油滴中;接下来在每个油滴内,凝胶珠溶解,细胞裂解释放 mRNA,通过逆转录产生带有 10X barcode 和 UMI 信息的 cDNA。破油(Breaking ...
本标准适用于基于10X平台的单细胞TCR测序数据的分析流程软件标准分析流程。 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 29859生物信息学术语 GB/T 34798核酸数据库序列格式规...
1、针对现有技术的不足和实际需求,本发明提供一种单细胞转录组与tcr和bcr测序数据的整合分析方法,建立单细胞转录组+tcr/bcr测序数据联合分析的生物信息学分析流程,获得转录组数据不同t/b细胞的免疫组库特征。 2、为达上述目的,本发明采用以下技术方案:
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目的:采用单细胞测序的方法,分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征,探讨其可能的发病机制.方法:利用NCBI数据库获得数据,设置对照组,进展组和康复组.使用RStudio,Origin,Hipliot和Excel软件对单细胞测序数据进行分析.结果:TCR在识别抗原和清除病毒的过程中发挥重要作用,免疫组库特征在不同感染时期有很大差异...
无锡市第五人民医院拟对肝衰患者单细胞层面TCR/BCR技术检测联合血清病毒DNA二代测序及粪便16S测序分析检测服务项目进行公开谈价,欢迎符合相关条件的单位参加报价。 一、项目名称: 肝衰患者单细胞层面TCR/BCR技术检测联合血清病毒DNA二代测序及粪便16S测序分析检测服务 ...
T 细胞大颗粒淋巴细胞白血病 (T-LGLL) 是一种淋巴组织增生性疾病,通常表现为血细胞减少,通常以终末分化效应记忆细胞毒性 T 淋巴细胞 (CTL) 的克隆扩增为特征。作者将单细胞 TCR 测序 (scTCR SEQ) 结合 scrna SEQ 应用于从 t-lgll 患者获得的 CD3 + T 细胞,以确定 T-LGLL