此外,我们看到 GATA1 和 GATA2 出现在我们的列表中,它们不是肥大细胞标记基因,而是在肥大细胞中大量表达,并且是调节各种肥大细胞特异性基因的已知转录因子。 6.4. 可视化marker基因 为了更好地了解簇 20 的细胞类型身份,我们可以使用FeaturePlot()函数按簇探索不同已识别标记的表达。 # 绘制簇 20 的标记基因表达 Fe...
使用FindAllMarkers()函数,我们将每个簇与所有其他簇进行比较,以识别潜在的标记基因。每个簇中的细胞被视为重复,本质上是通过一些统计测试进行差异表达分析。 注意:默认为 Wilcoxon 秩和检验,但还有其他可用选项。 FindAllMarkers()函数具有三个重要参数,它们提供了确定基因是否为标记的阈值: logfc.threshold:簇中基因...