本研究将用于一体化蛋白质组学样品制备的微流控芯片和用于单细胞蛋白质组学分析的数据非依赖性采集（DIA）质谱相结合（chip-DIA），在20个哺乳动物细胞中平均分析约1500个蛋白质；并应用chip-DIA
蛋白质的亚细胞定位显示,大多数已鉴定的蛋白质(56%)属于细胞质,其次是细胞核(27%)和质膜(8%),鉴定的蛋白质中,酶占大多数(961 种蛋白质),还伴有 262 种转运蛋白、227 种转录调节因子、145 种激酶和 64 种磷酸酶。 图3.单细胞蛋白组基本分析(PCA降维聚类、差异分析、蛋白亚细胞定位、蛋白功能注释) 02 单细...
率先开发并推出全新高深度10X Proteomics技术,实现常规蛋白质组的高深度覆盖,并进一步将10X Proteomics技术运用于单细胞蛋白质组学,在单细胞的检测通量、灵敏度及精准定量等多个维度持续进行革命性的升级,极大地提升了单细胞蛋白质组学的分析性能,达到单细胞蛋白组学前所未有的覆盖深度,助力实现对单细胞生物学功能更深的...
11、在使用PCF空间单细胞蛋白组(原Codex)实验抗体染色期间,溶液中的大量抗体是否会影响抗体-抗原识别? 不会,抗体-抗原特异性识别不受PCF空间单细胞蛋白组实验的高多重水平的影响,主要有两个因素:(1)染色液中抗体的总浓度很低,即使是50个抗体的panel 也大约在~1μM;(2)空间位阻是一种局部现象,涉及到nm级别的...
单细胞组学技术研究也开始了爆炸式增长。
一、单细胞蛋白质组学技术的原理和方法 1.单细胞样品制备：单细胞蛋白质组学的关键是获取单个细胞的蛋白质样品。常用的方法包括微操作、流式细胞分选和单细胞捕获技术，确保获取纯净的单细胞样品。2.蛋白质提取和消化：从单个细胞中提取蛋白质，并通过蛋白酶消化将蛋白质降解为肽段，以便后续的质谱分析。3.单细胞...
单细胞蛋白组学是一个研究单个细胞内蛋白质表达和调控的领域,这种分辨率为研究者提供了关于细胞异质性、微环境影响以及细胞之间的交互等方面的深入了解。它与单细胞基因组学和单细胞转录组学相辅相成,共同为我们提供了更为全面的细胞层面的生物信息。 单细胞蛋白组学的技术 ...
而在这方面,基于质谱的无抗体标记技术有望解决单细胞蛋白组学面临的以上问题。*近有文献报道指出,采用新兴的单细胞蛋白组学质谱技术(SCoPE-MS)及其第二代(SCoPE2)技术可以实现对数百个单细胞样本中数千个蛋白进行定量分析[10]。然而,单细胞蛋白组学仍存在一些问题,如单细胞样本与设备连接困难,样本处理需精度高(样本...
传统的生物学研究是从多个细胞水平上进行,实验结果往往是细胞群体基因、蛋白表达的均值,或者只代表数量上占优势细胞的生命活动信息,而无法准确反映样本中细胞异质性的多种信息,忽略了细胞间基因表达调控的差异性。随着细胞分离和质谱技术的发展,单细胞组学已成为生命科学研究的基础有力工具。一方面解决了微量样品无法进行检...
本研究使用空间原位单细胞蛋白组学技术(PhenoCycler-Fusion)对人类肾脏样本进行了全面的成像检测,呈现出了肾脏中的主要细胞类型和亚结构,如肾脏集合管、肾小球和升支粗段等,为人类组织单细胞图谱的绘制贡献了巨大的力量,为肾脏疾病的研究奠定了基础。 皮肤肿瘤研究 ...