近期，哈佛大学和麻省理工学院的研究团队在微生物群落研究方法学上取得重要突破，发明了微生物高通量单细胞基因组学技术—Microbe-seq。相关成果以研究长文（Research Article）的形式于6月3日在Science上以High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome为题发表。...
单细胞微生物基因组测序通过将单个微生物细胞分离并进行基因组DNA扩增,然后对其进行高通量测序,从而获得单个细胞的基因组序列。这种方法可以解决微生物群体中存在的细胞异质性问题,揭示不同细胞之间的遗传变异和功能差异。此外,单细胞测序还可以用于研究微生物在复杂环境中的生态功能和亚群体分化。 技术原理 技术原理图 应...
3.功能基因分析:单细胞测序可用于研究微生物基因组中的功能基因,从而理解微生物在生态系统中的生态和生理功能,包括代谢途径、致病性基因和环境适应性基因。 4.微生物进化研究:通过比较不同微生物细胞的基因组,可以了解微生物的进化历史和亲缘关系,揭示它们是如何适应不同环境条件的。 5.抗生素和代谢工程:单细胞测序有...
为了填补瘤胃微生物组中活性功能类群的研究空白,研究团队开发了一种全新方法——微生物组单细胞转录组学技术(Microbiome single-cell Transcriptomics,MscT),构建了目前最全面的牛胃肠道微生物基因组图谱(Bovine Gastro Microbial Genome Map,BGMGM)作为参考数据集,利用基于随机引物和微流控的微生物单细胞RNA-Seq技术测定...
00:00/00:00 单细菌转录组测序新技术——微生物单细胞组学研究里程碑 上海凌恩生物发布于:陕西省2024.01.19 10:01 分享到
图1. 微生物组单细胞转录组研究流程 基于MscT,研究团队构建了一个涵盖17,4531个微生物细胞和2,534个物种的瘤胃微生物单细胞转录组图谱,揭示了瘤胃微生物在单细胞水平上的功能分工;共鉴定出12个功能类群,每个类群由表达特定代表性功能基因的细胞组成。例如,功能类群“HSP90+ HMACs”中的细胞特异性表达HSP90蛋白,这...
此次大会以“技术创新、科学发现、转化应用”为主题,吸引了来自全球的单细胞及空间组学领域的专家学者、科研人员以及企业代表共襄盛举。派森诺携独家首创的微生物单细胞测序新产品smRNAPSN-seq亮相此次大会,并成功吸引了众多与会者的关注。 本次大会内容丰富多彩,不仅聚焦单细胞研究,更广泛涉及基因组、转录组、蛋白组、...
1、2,534个微生物的单细胞转录组学揭示了瘤胃微生物组中的功能异质性 Single-cell transcriptomics across 2,534 microbial species reveals functional heterogeneity in the rumen microbiome Nature Microbiology; IF:28.300; DOI: 10.1038/s41564-024-01723-9 ...
关联高端霸气上档次的单细胞转录组技术,扩增子研究依旧可以焕发新生机,重回高大上。 近日,檀国大学在《communications biology》上最新发表的文章打破了传统微生物组分析的界限,利用16s扩增子和单细胞转录组测序技术,在获取肠道微生物群落结构的同时,从单细胞层面挖掘了UC病患的异质性和复杂性,为UC宿主细胞与肠道微生物...
近年来,随着多篇关于微生物单细胞转录组测序的文献陆续发表,单个菌体或混合菌体的微生物单细胞转录组研究方法已日趋成熟。这不仅极大地拓展了微生物组学的研究领域,更开启了微生物组学测序的新篇章。这背后的推动力,正是科研工作者们对微生物组学研究的执着追求,以及对微生物单细胞转录组测序技术更高的期待。