R的Seurat包中就有一个函数叫VlnPlot,专门用来画小提琴图的。 我们来看看这个函数的参数和使用方法 我们用Seurat单细胞绘图函数DimHeatmap中的数据来举个例子。 我们看CD3E这个基因在不同细胞亚群中的表达情况,先用默认参数看看效果 load("scRNA.rds")library(Seurat)library(ggplot2)VlnPlot(scRNA,features="CD3E"...
联系转录组特征和表型特征是非常常见的操作,这次的视频,我以文献中一个小图为例,讲解了在均值比较中常见的箱型图、小提琴图,以及几种变形。视频已经上传B站,这是链接:跟着Cell Research学单细胞分析:箱型图、小提琴图、误差棒,总有一款适合你_哔哩哔哩_bilibili 视频中涉及到的知识点包括: 分组箱型图/小提琴图...
做单细胞数据分析的时候,我们经常会用小提琴图来展示一些marker在不同细胞亚群中的表达情况。R的Seurat包中就有一个函数叫VlnPlot,专门用来画小提琴图的。 我们来...
做单细胞数据分析的时候,我们经常会用小提琴图来展示一些marker在不同细胞亚群中的表达情况。R的Seurat包中就有一个函数叫VlnPlot,专门用来画小提琴图的。 我们来看看这个函数的参数和使用方法 我们用Seurat单细胞绘图函数DimHeatmap中的数据来举个例子。 我们看CD3E这个基因在不同细胞亚群中的表达情况,先用默认参数...
单细胞小提琴图+箱型图 做单细胞数据分析的时候,我们经常会用小提琴图来展示一些marker在不同细胞亚群中的表达情况。R的Seurat包中就有一个函数叫VlnPlot,专门用来画小提琴图的。 我们来看看这个函数的参数和使用方法 我们用Seurat单细胞绘图函数DimHeatmap中的数据来举个例子。
联系转录组特征和表型特征是非常常见的操作,这次的视频,我以文献中一个小图为例,讲解了在均值比较中常见的箱型图、小提琴图,以及几种变形。视频已经上传B站,这是链接:跟着Cell Research学单细胞分析:箱型图、小提琴图、误差棒,总有一款适合你_哔哩哔哩_bilibili ...
做单细胞数据分析的时候,我们经常会用小提琴图来展示一些marker在不同细胞亚群中的表达情况。R的Seurat包中就有一个函数叫VlnPlot,专门用来画小提琴图的。 我们来看看这个函数的参数和使用方法 我们用Seurat单细胞绘图函数DimHeatmap中的数据来举个例子。