如上所述,我们的拟合方法是一种两步法(two-step approach),首先估计遗传方差的权重,然后用估计得到的权重,通过EMMA/GEMMA来估计方程7和8中所示模型的方差分量。在此之外,一些通过AIREML(average information REML,平均信息受限最大似然)[43]直接估计方程1的方差分量的拟合方法也已经被提出,并在一些包/软件[44, 45...
在比较了我们的方法、传统的单一SNP GWAS、传统的基于单倍型的GWAS和传统的SNP-set GWAS的性能之后,我们提出的方法在以下三个方面优于其他方法:(1)对假阳性的控制;(2)如果数据集中有causal变异的基因型,则无需依赖连锁不平衡来检测;(3)它比其他方法展示出更强的能力,即它能够检测到其他方法没有检测到的causal变...
百度试题 结果1 题目基因诊断间接方法不包括 A. 基于SNP的单倍型石析 B. Southenblot C. 基于STR的微卫星分析 D. PCR-PFLP E. RFLP连锁分析 相关知识点: 试题来源: 解析 B 反馈 收藏
百度试题 结果1 题目基因诊断间接方法不包括 A. 基于 SNP 的单倍型分析 B. Southern blot C. 基于 STR 的微卫星分析 D. PCR-RFLP E. RFLP 连锁分析 相关知识点: 试题来源: 解析 B 反馈 收藏
基因诊断间接方法不包括A.基于SNP的单倍型分析B.Southern blotC.基于SNP的微卫星分析D.PCR-RFLPE.RFLP连锁分析
与通过AIREML的直接估计方法相比,我们的两步法优势在于权重的搜索空间限于区间[0,1][0,1],并且即使在遗传性(heritability)太低/太高的情况下,结果的收敛性(convergence)也相对有保证。 GWAS的似然比检验 为了检验每个SNP-set的显著性,我们对σ2riσri2是否为0进行了似然比检验(likelihood ratio test, LR test...