未来需要进行基因组编辑研究,以确定打乱各种3D组织特征的功能后果,以阐明3D基因组破坏导致NAFLD的机制。此外,破译由组蛋白修饰、DNA甲基化和非编码rna介导的表观遗传机制的组合是精确确定遗传重排和空间组织破坏所必需的,并可能揭示NAFLD的新机制和确定新的治疗靶点。 文章来源: pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34
2021年7月2日,上海交通大学医学院与北京百迈客生物科技有限公司合作的文章发表在NEURO-ONCOLOGY(IF12.3)上,研究团队利用RNA-seq、ATAC-seq和Hi-C检测技术,揭示了骨微环境在脊索瘤发生中的作用,并将CA2蛋白确定为脊索瘤的治疗新靶点,此外...
但检测所需大量的RNA阻碍了哺乳动物早期胚胎中的m6A分析。本研究通过应用低起始量的甲基RNA免疫沉淀和测序技术(picoMeRIP-seq),成功绘制了小鼠卵母细胞和着床前胚胎中N6-甲基腺苷(m6A)修饰的动态图谱,揭示了m6A修饰在调控早期胚胎发育、基因表达、母体到合子转换过程中的关键作用,以及m6A通过在逆转录转座子衍生的RNA...
RNA-seq 通常用于大规模探索和功能筛选,其结果反应的是样本整体的基因表达变化趋势,但不能保证每一个基因的变化趋势都与qPCR 一致。RNA-seq 与qPCR 是基于两种不同原理的实验技术, 两者的分析结果存在一定的不一致性,属于正常现象。解决方案:● 挑选合适的基因进行验证选择与研究思路相关的目标或者候选基因验证(至少2...
最近在Nature Protocols杂志上在线发表的一篇文章1介绍了利用NimbleGen序列捕获技术进行转录组定向测序,用于RNA研究中基因发现和表达定量。 RNAseq技术在基因表达研究中得到了广泛的应用,可对表达基因进行无偏见的采样。相比定量PCR可以对更广泛的基因同步分析,相比芯片方法RNAseq测序结果准确性也更高。然而,真核细胞的表达...
利用RNA-seq筛选调控当归抽薹主要候选基因 当归提前抽薹严重影响产量,而当归抽薹分子遗传机理尚不清楚.本研究利用RNA-seq技术对连续五代抽薹当归的叶片,茎段,种子,根进行测序,对所有组装后的Unigenes进行功能注... 郭李智,宗渊,席杏媛,... - 《分子植物育种》 被引量: 0发表: 2021年 茎瘤芥CRISPR/Cas9技术的...
摘要: 为探究淹水胁迫下BnERF调节的耐淹防御相关途径, 应用RNA-seq技术, 对淹水6小时后的拟南芥(Arabidopsis thaliana)野生型(WT)和转BnERF株系(E33)幼苗进行基因表达分析。结果表明, 淹水3天后, E33表现出较强的耐淹性, 地上部生长状况和根系发育均明显强于野生型。E33幼苗未淹水处理时相对于野生型单独上调的...
12 月 21 日《Nature Biotechnology》发表了一篇文章,比较了不同技术和不同实验室产生的不同单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)数据集。Loma Linda 大学的研究人员提出了在选择算法时需要指导的问题,从而能够对不同平台获得的不同数据类型进行精确的生物学解释。
但检测所需大量的RNA阻碍了哺乳动物早期胚胎中的m6A分析。本研究通过应用低起始量的甲基RNA免疫沉淀和测序技术(picoMeRIP-seq),成功绘制了小鼠卵母细胞和着床前胚胎中N6-甲基腺苷(m6A)修饰的动态图谱,揭示了m6A修饰在调控早期胚胎发育、基因表达、母体到合子转换过程中的关键作用,以及m6A通过在逆转录转座子衍生的RNA...
N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物中RNA最常见的内部修饰,在多种生物过程,如RNA稳定性、剪接、转运和翻译中发挥关键调控作用。但检测所需大量的RNA阻碍了哺乳动物早期胚胎中...